Představujeme nové schopnosti GPT‑Rosalind
Přinášíme vyšší inteligenci ukotvenou v reálných vědeckých workflow pro odvětví biologických věd.
Představujeme novou aktualizaci modelu v naší řadě GPT‑Rosalind, cíleně vytvořenou pro výzkum v biologických vědách v podnikovém měřítku. Kombinuje schopnosti GPT‑5.5 v oblasti agentního kódování a používání nástrojů se silnější inteligencí modelu v klíčových doménách objevování léčiv, jako je medicinální chemie a genomika, a zároveň zlepšuje výkon v širší analýze, návrhu a experimentálních workflow biologických věd.
Pokrok v biologických vědách závisí na syntéze dat a důkazů napříč měřítky a modalitami: molekulami, geny, drahami a živými systémy. V našich hodnoceních aktualizovaný GPT‑Rosalind vykazuje široké zlepšení výkonu v úlohách od biologických expertů, složitých dotazech z medicinální chemie, kvantitativní biologii a řešení problémů v mokré laboratoři.
GPT‑Rosalind je nyní dostupný v režimu výzkumného preview způsobilým organizacím po celém světě prostřednictvím naší struktury nasazení s důvěryhodným přístupem.
Abychom mohli měřit a průběžně zlepšovat reálný dopad GPT‑Rosalind, navrhli jsme LifeSciBench, benchmark posuzovaný externími experty a zaměřený na základní aspekty výzkumu v biologických vědách. Na rozdíl od existujících benchmarků, které izolovaně hodnotí jednu složku výkonu modelu nebo biologickou doménu, LifeSciBench nahlíží vědecky hodnotnou práci od začátku do konce a čerpá úlohy ze šesti oblastí workflow zásadních pro výzkum v biologických vědách: práce s důkazy, analýza, návrh a optimalizace, vědecké uvažování, validace a provoz, překlad a komunikace. Tento benchmark používáme k tomu, abychom sladili pokrok s potřebami a realitou výzkumu v biologických vědách.
GPT‑Rosalind vede ve výkonu napříč vědecky hodnotnými úlohami identifikovanými odborníky z průmyslu a akademické sféry.
GPT‑Rosalind dosahuje špičkového výkonu v medicinální chemii, oboru zaměřeném na přeměnu molekul v užitečná léčiva. MedChemBench jsme navrhli tak, aby odrážel realistická workflow medicinální chemie: hodnotí multimodální porozumění chemickým strukturám; vztah struktury a aktivity (SAR); predikci účinnosti, toxicity a absorpce, distribuce, metabolismu a exkrece (ADME) léčiv; rozhodování při multiparametrické optimalizaci leadů; a retrosyntézu. GPT‑Rosalind překonává GPT‑5.5 na MedChemBench výsledkem 27,5 % oproti 25,1 % a zároveň používá o 7,2 % méně tokenů.
GPT‑Rosalind vykazuje lepší multimodální syntézu a mechanistické uvažování v medicinální chemii.
Na GeneBench, našem agentním hodnocení dlouhodobé end-to-end analýzy v genomice a kvantitativní biologii, používá GPT‑Rosalind o 31 % méně tokenů než GPT‑5.5 a dosahuje vyšší přesnosti 21,6 % oproti 20,4 %. GeneBench hodnotí agentní výkon v dlouhodobých kvantitativních úlohách: dokáže agent na základě realistických vědeckých dat naplánovat validní analýzu, kontrolu kvality, modelování a korekce a dojít k odpovědím relevantním pro rozhodnutí? Zahrnuté problémy pokrývají různé domény včetně funkční genomiky, prostorové transkriptomiky, proteomiky, epigenomiky a aplikované genetiky.
GPT‑Rosalind používá o 31 % méně tokenů než GPT‑5.5 a zároveň zlepšuje přesnost.
Zavádíme nové hodnocení, které testuje schopnost GPT‑Rosalind pomáhat vědcům provádějícím laboratorní práci v reálném světě. LabWorkBench testuje schopnost modelu propojit perturbace s experimentálními výsledky ve skutečných protokolech mokré laboratoře používaných vědci, a to pro účely od řešení problémů po optimalizaci. Data používaná LabWorkBench jsou proprietární, a tedy nekontaminovaná. GPT‑Rosalind dosahuje 63,2 % oproti 55,8 % u GPT‑5.5 a zároveň používá o 5,3 % méně tokenů.
Pokud jde o pomoc s protokoly v reálných podmínkách mokré laboratoře, vykazuje GPT‑Rosalind významné zlepšení oproti GPT‑5.5 a zároveň zvyšuje efektivitu tokenů.
Vytvořili jsme pluginy Life Sciences Research(otevře se v novém okně) a Life Sciences NGS Analysis(otevře se v novém okně), které rozšiřují zvýšenou inteligenci GPT‑Rosalind o praktickou realizační vrstvu pro opakovatelná vědecká workflow. Společně tyto pluginy přinášejí vyhledávání ozdrojovaných důkazů, biologickou interpretaci a bioinformatické provádění do stejného pracovního prostoru a pomáhají výzkumníkům propojovat externí důkazy s interními omickými analýzami při zachování artefaktů a původu dat. Všichni uživatelé nyní mohou k oběma pluginům přistupovat prostřednictvím Codexu. Kvalifikovaní podnikoví uživatelé GPT‑Rosalind mohou navíc používat GPT‑Rosalind k pohonu těchto pluginů.
Abychom lépe využili Codex jako dynamickou pracovní plochu pro vědce, přidali jsme interaktivní prohlížeče pro biologicky nativní typy souborů. Počáteční sada prohlížečů sekvencí, zarovnání a struktur je navržena tak, aby vědce držela blízko důkazům, zatímco GPT‑Rosalind uvažuje napříč workflow, a aby na následné otázky odpovídala přímo s využitím aktivního prohlížeče v kontextu.
Ukázka výše předvádí tyto schopnosti v praxi, kdy je orchestrátorem GPT‑Rosalind. Sledujeme vědce zkoumajícího tekutou biopsii nádoru s cílem identifikovat mutace a další molekulární změny, které by mohly napovědět při léčbě. Plugin Life Sciences NGS Analysis promění revizi zpracovaných záznamů ctDNA v interaktivní notebook, který odhaluje opakující se alterace, nízkofrekvenční volání a trajektorie vzorků zaměřující vyšetřování na KRAS G12C. Odtud plugin Life Sciences Research doplňuje ozdrojovaný kontext cíle, inhibitoru a rezistence, zatímco nativní prohlížeče sekvencí, zarovnání a struktur umožňují vědci přímo prozkoumat mutantní zbytek 12, jeho konzervovanost napříč rodinou RAS a kapsu vázanou na inhibitor. Workflow končí převedením těchto důkazů do konkrétních možností následného postupu, přičemž každý krok a artefakt je dostupný pro expertní kontrolu.
Plugin Life Sciences NGS Analysis
Kontrola kvality a anotace scRNA-seq
Převeďte balíček matic ve stylu 10x na jednobuněčné artefakty filtrované kontrolou kvality, anotace a UMAPy, které můžete prohlížet a upravovat v Codexu. Plugin Life Sciences NGS Analysis směruje požadavek na scrna-seq-qc, volí prahy QC z dat, zachovává původ dat kolem filtrování a anotace a odhaluje blokátory, jako jsou chybějící závislosti pro detekci doubletů.
Kontrola kvality bulk RNA-seq FASTQ
Ze vzorkového listu bulk RNA-seq, balíčku FASTQ a referenčních souborů vytvořte balíček počtů zkontrolovaný kontrolou kvality, který můžete prohlížet a znovu použít v Codexu. Plugin Life Sciences NGS Analysis směruje požadavek, validuje vstupy a vrací auditovatelný obal běhu s MultiQC, maticemi Salmon, původem dat a explicitními výhradami.
Rozšiřujeme přístup k řadě GPT‑Rosalind pro způsobilé organizace po celém světě. GPT‑Rosalind bude dostupný ve výzkumném preview prostřednictvím naší struktury nasazení s důvěryhodným přístupem pro organizace, které provádějí legitimní vědecký výzkum s jasným veřejným přínosem, mají silné řízení a bezpečnostní dohled a kontrolovaný přístup se zabezpečením podnikové úrovně.
V rámci tohoto globálního rozšíření rádi pomůžeme podpořit misi společnosti Novo Nordisk přinášet pacientům inovativní možnosti léčby rychleji tím, že jí pomůžeme škálovat lékařský výzkum pomocí GPT‑Rosalind. Novo Nordisk využívá špičkové schopnosti AI, aby pomohl výzkumníkům analyzovat složité datové sady, odhalovat užitečné vzorce a rychleji testovat hypotézy. Silnější biologické porozumění GPT‑Rosalind pomůže týmům propojovat důkazy napříč literaturou, genomikou, transkriptomikou, sekvencemi, strukturami a experimentálními výsledky, takže bude snazší přecházet od dat k jasnějším výzkumným rozhodnutím.
„Výzkum v biologických vědách je složitý, bohatý na data a interdisciplinární. Aby pokročilé modely AI přinášely výzkumníkům smysluplnou hodnotu, musí být ukotveny v důvěryhodných vědeckých datech, propojeny s validovanými nástroji a integrovány do reálných workflow, která výzkumníci používají každý den. Těší nás naše partnerství s OpenAI a příležitost zkoumat, jak může GPT‑Rosalind podporovat přísnější a praktičtější přístupy k objevování léčiv.“
Mishal Patel, Group Vice President, AI & Digital Innovation, R&D - Novo Nordisk
Nyní také nabízíme pracovní prostor spravovaný OpenAI pro kvalifikované organizace bez účtu Enterprise.
Aktualizovaný GPT‑Rosalind je dalším krokem v našem širším závazku budovat systémy AI, které mohou pomáhat urychlovat vědecké objevy a zároveň zajišťovat, aby pokročilé biologické schopnosti byly nasazovány s vhodnými ochrannými opatřeními. Budeme dál zlepšovat biologické uvažování modelu, rozšiřovat podporu pro výzkumná workflow náročná na nástroje a s dlouhým horizontem a spolupracovat s kvalifikovanými organizacemi napříč regiony na hodnocení reálného dopadu.
To také znamená aplikovat AI pro biologické vědy na práci s vysokým dopadem a veřejným přínosem, od objevování léčiv a translační medicíny po veřejné zdraví, připravenost a biologickou obranu. Prostřednictvím Rosalind Biodefense a našeho modelu nasazení s důvěryhodným přístupem chceme dostat špičkové biologické schopnosti do rukou výzkumníků, institucí a obránců, kteří pracují na zlepšení lidského zdraví a posílení společenské odolnosti.
Budeme nadále budovat GPT‑Rosalind, aby se stal schopnějším partnerem napříč celým životním cyklem vědeckého výzkumu a pomáhal vědcům rychleji postupovat od správných otázek k jasnějším důkazům, lepším experimentům a nakonec k tvorbě nové léčby pro pacienty.
