NGS Analysis Workbench
Analyzujte sekvenační data
- Schopnosti
- Interactive, Read, Write
- Kategorie
- Data
- Vývojář
- OpenAI
- Webové stránky
- (otevře se v novém okně)
Jak to funguje
Pracovní prostředí pro NGS, které provází kontrolou kvality FASTQ, bulk RNA-seq a RNA-seq jednotlivých buněk. Specializované dovednosti určují výchozí situaci uživatele, navrhují postup k dosažení vědeckého výsledku a propojují jej s aktuálně dostupnými možnostmi Nextflow/nf-core nebo Snakemake. Zachovávají nativní schvalování vázané na kontrolní součet a interpretují hotové výsledky na základě podkladů uložených v souborech.
Co dalšího umíš?
Posuďte kvalitu sekvenování
NGS Analysis Workbench Zkontroluj tyto sekvenační vstupy a upřesni cíl analýzy. Vyber podporovaný postup kontroly kvality, ověř předpoklady a interpretuj hotové zprávy s využitím uložených artefaktů.
Naplánujte analýzu sekvenování RNA
NGS Analysis Workbench Posuď vstupy a návrh této studie bulk RNA-seq. Doporuč podporovaný analytický postup, urči chybějící metadata a vysvětli, co je třeba před spuštěním zkontrolovat.
Interpretujte výsledky sekvenování
NGS Analysis Workbench Posuď tyto hotové výstupy analýzy sekvenačních dat. Shrň problémy s kvalitou a výsledky, odliš zjištění od předpokladů a odkaž na soubory, které zjištění dokládají.
Co je součástí
dovedností
- Design NGS Analysis
- NGS Analysis Workbench
- Run NGS Analysis
- Understand NGS Data
- Understand NGS Results
Zdroje
Přidat plugin NGS Analysis Workbench na pár kliknutí
Dostupnost závisí na pluginu, plánu a nastavení pracovního prostoru. Některá připojení vyžadují nastavení nebo schválení správcem. Pokud je přístup zablokovaný, kontaktujte správce pracovního prostoru.
Prozkoumat související pluginy
Data
Převádějte data na jasná rozhodnutí.
Life Sciences Literature
Najděte biomedicínské články, preprinty a volně přístupné plné texty
Life Sciences NGS Analysis
Řízená volba postupu NGS a místní provádění analýzy sekvenování
BioRender
Vyhledávejte a vytvářejte ilustrace
Documents
Vytváření a úpravy dokumentů
Zotero
Vyhledávejte odborné články a přidávejte citace ze Zotera
