Представяме нови възможности за GPT‑Rosalind
Повече интелект, основан на реални научни работни процеси за индустрията на науките за живота.
Представяме нова актуализация на модел в нашата серия GPT‑Rosalind, създадена специално за изследвания в науките за живота в корпоративен мащаб. Тя съчетава възможностите на GPT‑5.5 за агентно кодиране и използване на инструменти с по-силен интелект на модела в ключови области на откриването на лекарства, като медицинска химия и геномика, като същевременно подобрява представянето в по-широк анализ, дизайн и експериментални работни процеси в науките за живота.
Напредъкът в науките за живота зависи от синтезирането на данни и доказателства в различни мащаби и модалности: молекули, гени, пътища и живи системи. В нашите оценки обновеният GPT‑Rosalind показва широки подобрения в изследователски задачи от експерти по биология, сложни заявки по медицинска химия, количествена биология и отстраняване на проблеми във wet lab.
GPT‑Rosalind вече е наличен като изследователски преглед за отговарящи на условията организации по целия свят чрез нашата структура за внедряване с доверен достъп.
За да измерваме и непрекъснато подобряваме реалното въздействие на GPT‑Rosalind, създадохме LifeSciBench — бенчмарк, оценяван от външни експерти и фокусиран върху основополагащи аспекти на изследванията в науките за живота. За разлика от съществуващите бенчмаркове, които оценяват единичен компонент от представянето на модела или биологична област изолирано, LifeSciBench разглежда научно ценната работа от край до край чрез задачи от шест области на работни процеси, централни за изследванията в науките за живота: работа с доказателства, анализ, дизайн и оптимизация, научно структурирано анализиране, валидиране и операции, както и превод и комуникация. Използваме този бенчмарк, за да съгласуваме напредъка с нуждите и реалностите на изследванията в науките за живота.
GPT‑Rosalind води по представяне в научно ценни задачи, идентифицирани от индустриални и академични експерти.
GPT‑Rosalind постига водещо за индустрията представяне в медицинската химия — област, насочена към превръщането на молекули в полезни лекарства. Създадохме MedChemBench, за да отразим реалистични работни процеси в медицинската химия, оценявайки мултимодално разбиране на химични структури; връзка структура–активност (SAR); прогнозиране на лекарствена потентност, токсичност и абсорбция, разпределение, метаболизъм, екскреция (ADME); многопараметрично вземане на решения за оптимизация на водещи съединения; и ретросинтез. GPT‑Rosalind превъзхожда GPT‑5.5 с 27,5% срещу 25,1% в MedChemBench, като използва 7,2% по-малко токени.
GPT‑Rosalind показва по-добър мултимодален синтез и механистично структурирано анализиране в медицинската химия.
В GeneBench, нашата агентна оценка за дългосрочен анализ от край до край в геномиката и количествената биология, GPT‑Rosalind използва 31% по-малко токени от GPT‑5.5, като постига по-висока точност от 21,6% срещу 20,4%. GeneBench оценява агентно представяне при дългосрочни количествени задачи: въз основа на реалистични научни данни може ли Агент да планира валиден анализ, QC, моделиране и корекции, за да достигне до отговори, релевантни за решения? Включените проблеми обхващат различни области, включително функционална геномика, пространствена транскриптомика, протеомика, епигеномика и приложна генетика.
GPT‑Rosalind използва 31% по-малко токени от GPT‑5.5, като подобрява точността.
Въвеждаме нова оценка, за да тестваме способността на GPT‑Rosalind да помага на учени, извършващи лабораторна работа в реалния свят. LabWorkBench тества способността на модела да свързва смущенията с експерименталните резултати в реални wet lab протоколи, използвани от учени, за цели от отстраняване на проблеми до оптимизация. Данните, използвани от LabWorkBench, са собственически и следователно незамърсени. GPT‑Rosalind постига 63,2% срещу 55,8% за GPT‑5.5, като използва 5,3% по-малко токени.
При помощ за реални протоколи във wet lab GPT‑Rosalind показва значителни подобрения спрямо GPT‑5.5, като повишава ефективността на токените.
Създадохме плъгините Life Sciences Research(отваря се в нов прозорец) и Life Sciences NGS Analysis(отваря се в нов прозорец), за да разширим повишения интелект на GPT‑Rosalind с практически слой за изпълнение на повторяеми научни работни процеси. Заедно тези плъгини въвеждат извличане на доказателства с източници, биологична интерпретация и биоинформатично изпълнение в едно и също работно пространство, като помагат на изследователите да свързват външни доказателства с вътрешни омикс анализи, запазвайки артефактите и произхода. Всички потребители вече имат достъп до двата плъгина чрез Codex. Квалифицираните корпоративни потребители на GPT‑Rosalind могат допълнително да използват GPT‑Rosalind за захранване на тези плъгини.
За да използваме по-добре Codex като динамична работна среда за учени, добавихме интерактивни визуализатори за биологично нативни файлови типове. Първоначалният набор от визуализатори за последователности, подравнявания и структури е създаден, за да държи учените близо до доказателствата, докато GPT‑Rosalind анализира структурирано работния процес и отговаря директно на последващи въпроси, използвайки активния визуализатор в контекст.
Демото по-горе показва тези възможности в действие, оркестрирани от GPT‑Rosalind. Следваме учен, който изследва течна туморна биопсия, за да идентифицира мутации и други молекулни промени, които могат да информират лечението. Плъгинът Life Sciences NGS Analysis превръща прегледа на обработени ctDNA записи в интерактивен notebook, извеждайки повтарящи се изменения, нискочестотни calls и траектории на проби, които фокусират изследването върху KRAS G12C. Оттам плъгинът Life Sciences Research добавя контекст с източници за мишена, инхибитор и резистентност, докато нативните визуализатори за последователности, подравняване и структура позволяват на учения директно да инспектира мутантния остатък 12, неговата консервация в семейството RAS и джоба, свързан с инхибитора. Работният процес завършва с превеждане на тези доказателства в конкретни последващи опции, като всяка стъпка и артефакт са налични за експертен преглед.
Плъгин Life Sciences NGS Analysis
scRNA-seq QC & анотация
Превърнете 10x-style матричен пакет в QC-филтрирани едноклетъчни артефакти, анотации и UMAP-и, които можете да инспектирате и преработвате в Codex. Плъгинът Life Sciences NGS Analysis маршрутизира заявката към scrna-seq-qc, избира QC прагове от данните, запазва произхода около филтрирането и анотацията и извежда блокери като липсващи зависимости за doublet detection.
QC на bulk RNA-seq FASTQ
Превърнете sample sheet за bulk RNA-seq, FASTQ пакет и референтни файлове в прегледан чрез QC пакет с броеве, който можете да инспектирате и използвате повторно в Codex. Плъгинът Life Sciences NGS Analysis маршрутизира заявката, валидира входовете и връща одитируем run envelope с MultiQC, матрици Salmon, произход и изрични уговорки.
Разширяваме достъпа до серията GPT‑Rosalind за отговарящи на условията организации по целия свят. GPT‑Rosalind ще бъде наличен като изследователски преглед чрез нашата структура за внедряване с доверен достъп за организации, които провеждат легитимни научни изследвания с ясна обществена полза, имат силно управление и надзор на безопасността, както и контролиран достъп със сигурност от корпоративен клас.
Като част от това глобално разширяване с радост помагаме в подкрепа на мисията на Novo Nordisk да предоставя по-бързо иновативни възможности за лечение на пациентите, като подпомагаме мащабирането на медицинските им изследвания с GPT‑Rosalind. Novo Nordisk използва водещи AI възможности, за да помага на изследователите да анализират сложни набори от данни, да откриват полезни модели и да тестват хипотези по-бързо. По-силното биологично разбиране на GPT‑Rosalind ще помогне на екипите да свързват доказателства от литература, геномика, транскриптомика, последователности, структури и експериментални резултати, улеснявайки преминаването от данни към по-ясни изследователски решения.
„Изследванията в науките за живота са сложни, богати на данни и интердисциплинарни. За да предоставят значима стойност на изследователите, напредналите AI модели трябва да са основани на доверени научни данни, свързани с валидирани инструменти и интегрирани в реалните работни процеси, които изследователите използват всеки ден. Радваме се на партньорството си с OpenAI и на възможността да изследваме как GPT‑Rosalind може да подкрепи по-строги и практически подходи към откриването на лекарства.“
Мишал Пател, вицепрезидент на групата, AI и дигитални иновации, R&D - Novo Nordisk
Вече предлагаме и управлявано от OpenAI работно пространство за квалифицирани организации без Enterprise акаунт.
Обновеният GPT‑Rosalind е следващата стъпка в по-широкия ни ангажимент да изграждаме AI системи, които могат да ускорят научните открития, като същевременно гарантираме, че напредналите биологични възможности се внедряват с подходящи предпазни мерки. Ще продължим да подобряваме биологичното структурирано анализиране на модела, да разширяваме поддръжката за изследователски работни процеси с много инструменти и дълъг хоризонт и да работим с квалифицирани организации в различни региони, за да оценяваме реалното въздействие.
Това означава също прилагане на AI за науки за живота към работа с висока обществена полза — от откриване на лекарства и транслационна медицина до обществено здраве, готовност и биозащита. Чрез Rosalind Biodefense и нашия модел за внедряване с доверен достъп целим да предоставим водещи биологични възможности в ръцете на изследователите, институциите и защитниците, които работят за подобряване на човешкото здраве и укрепване на обществената устойчивост.
Ще продължим да изграждаме GPT‑Rosalind, за да стане по-способен партньор през целия жизнен цикъл на научните изследвания, помагайки на учените да преминават по-бързо от правилните въпроси към по-ясни доказателства, по-добри експерименти и в крайна сметка нови лечения за пациентите.
