運作方式
這是一款為次世代測序工作流程提供引導式資料接收、流程分派及執行的外掛程式。它協助 Codex 檢查本機測序輸入資料，只提出尚未解答且針對特定檢測的問題，盡可能選用公開或可免費取用、能在執行期間安裝的套件，在安裝前檢查現有工具是否可用，並執行支援的本機工作流程，同時提供驗證、記錄、清單、QC 報告及成品索引。它亦具備更深入的決策能力，涵蓋 BCL 解多工、FASTQ QC 執行與解讀、胚系、體細胞及 UMI panel DNA 變異、大量 RNA-seq 計數生成與差異表達分析、ATAC-seq、ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag，以及內置的 scRNA-seq 計數後 QC。
還可以做甚麼？
檢視測序品質
生命科學 NGS 分析：檢查這些測序輸入資料，並釐清分析目標。選擇支援的 QC 工作流程、檢查先決條件，並解讀已完成的報告及已儲存的成品。
規劃 RNA 測序分析
生命科學 NGS 分析：檢視這項大量 RNA-seq 研究的輸入資料及設計。建議支援的分析工作流程、找出缺少的元數據，並說明執行前所需的檢查。
解讀測序結果
生命科學 NGS 分析：檢視這些已完成的測序分析輸出。總結品質問題及結果、區分研究發現與假設，並引用相關佐證檔案。
包括以下內容
技能
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 另外 10 個
資源
只需按幾下，即可新增 Life Sciences NGS Analysis 外掛程式
可用情況取決於外掛程式、你的計劃及工作區設定。部分連接須由管理員設定或批准。如存取受阻，請聯絡工作區管理員。
