Ana içeriğe atla
OpenAI

GPT‑Rosalind’e yeni yetenekler kazandırıyoruz

Yaşam bilimleri sektörü için gerçek bilimsel iş akışlarına dayanan daha yüksek zekâ sunuyoruz.

Kurumsal ölçekte yaşam bilimleri araştırmaları için özel olarak tasarlanmış GPT‑Rosalind serimize yeni bir model güncellemesi sunuyoruz. GPT‑5.5’in ajan tabanlı kodlama ve araç kullanımı yeteneklerini, tıbbi kimya ve genomik gibi temel ilaç keşfi alanlarında daha güçlü model zekâsıyla birleştirirken, daha geniş yaşam bilimleri analizi, tasarımı ve deneysel iş akışlarında performansı ilerletir.

Yaşam bilimlerindeki ilerleme, verileri ve kanıtları moleküller, genler, yolaklar ve canlı sistemler gibi ölçekler ve modaliteler arasında sentezlemeye bağlıdır. Değerlendirmelerimizde güncellenmiş GPT‑Rosalind, biyoloji uzmanlarından gelen araştırma görevlerinde, karmaşık tıbbi kimya sorgularında, nicel biyolojide ve ıslak laboratuvar sorun gidermede geniş performans artışları gösteriyor.

GPT‑Rosalind artık güvenilir erişim dağıtım yapımız aracılığıyla dünya genelindeki uygun kuruluşlar için araştırma önizlemesi olarak kullanılabilir.

Bilimsel açıdan değerli görevlerde performansı iyileştirme

GPT‑Rosalind’in gerçek dünyadaki etkisini ölçmek ve sürekli iyileştirmek için, yaşam bilimleri araştırmalarındaki temel yönlere odaklanan ve dış uzmanlarca değerlendirilen bir kıyaslama olan LifeSciBench’i tasarladık. Model performansının tek bir bileşenini veya biyolojik alanı ayrı ayrı değerlendiren mevcut kıyaslamalardan farklı olarak LifeSciBench, yaşam bilimleri araştırmaları için merkezi olan altı iş akışı alanından görevler alarak bilimsel açıdan değerli çalışmaya uçtan uca bakar: kanıt işleme, analiz, tasarım ve optimizasyon, bilimsel akıl yürütme, doğrulama ve operasyonlar, çeviri ve iletişim. Bu kıyaslamayı, ilerlemeyi yaşam bilimleri araştırmalarının ihtiyaçları ve gerçekleriyle uyumlu hale getirmek için kullanıyoruz.

GPT‑Rosalind, sektör ve akademi uzmanlarınca belirlenen bilimsel açıdan değerli görevlerde performansa öncülük ediyor.

Daha güçlü bilimsel akıl yürütme

Tıbbi kimya

GPT‑Rosalind, molekülleri yararlı ilaçlara dönüştürmeye odaklanan tıbbi kimyada sektör lideri performans elde ediyor. MedChemBench’i gerçekçi tıbbi kimya iş akışlarını yansıtacak şekilde tasarladık; çok modlu kimyasal yapı anlayışını, yapı-aktivite ilişkisini (SAR), ilaç gücü, toksisite ve emilim, dağılım, metabolizma, atılım (ADME) tahminini, çok parametreli öncü optimizasyonu kararlarını ve retrosentezi değerlendirir. GPT‑Rosalind, MedChemBench’te %27,5 alarak %25,1'de kalan GPT‑5.5’i geride bırakırken %7,2 daha az token kullanır.

GPT‑Rosalind, tıbbi kimyada daha iyi çok modlu sentez ve mekanistik akıl yürütme gösteriyor.

Genomik ve nicel biyoloji

Genomik ve nicel biyolojide uzun ufuklu, uçtan uca analiz için ajan tabanlı değerlendirmemiz GeneBench’te GPT‑Rosalind, GPT‑5.5’ten %31 daha az token kullanırken %20,4’e karşı %21,6 ile daha yüksek doğruluk elde ediyor. GeneBench, uzun ufuklu nicel görevlerde ajan tabanlı performansı değerlendirir: gerçekçi bilimsel verilere dayanarak bir otonom ajan, kararla ilişkili yanıtlara ulaşmak için geçerli analiz, QC, modelleme ve düzeltmeler planlayabilir mi? Dahil edilen problemler fonksiyonel genomik, uzamsal transkriptomik, proteomik, epigenomik ve uygulamalı genetik dahil çeşitli alanlara yayılır.

GPT‑Rosalind doğruluğu artırırken GPT‑5.5’ten %31 daha az token kullanır.

Gerçek dünya laboratuvar çalışmalarına yardım

GPT‑Rosalind’in gerçek dünyada laboratuvar çalışması yürüten bilim insanlarına yardımcı olma becerisini test etmek için yeni bir değerlendirme sunuyoruz. LabWorkBench, bilim insanlarının kullandığı gerçek ıslak laboratuvar protokollerinde modelin perturbasyonları deneysel sonuçlarla ilişkilendirme becerisini sorun gidermeden optimizasyona kadar çeşitli amaçlarla test eder. LabWorkBench’in kullandığı veriler tescillidir ve bu nedenle kontamine değildir. GPT‑Rosalind, GPT‑5.5’in %55,8’ine karşı %63,2 puan alırken %5,3 daha az token kullanır.

Gerçek ıslak laboratuvar protokolü desteğinde GPT‑Rosalind, token verimliliğini artırırken GPT‑5.5’e göre anlamlı kazanımlar gösteriyor.

Akıl yürütme aşamasından, yürütülen iş akışlarına uzanan süreç

Life Sciences Research(yeni bir pencerede açılır) ve Life Sciences NGS Analysis(yeni bir pencerede açılır) eklentilerini, GPT‑Rosalind’in artan zekasını tekrarlanabilir bilimsel iş akışları için pratik bir yürütme katmanıyla genişletmek üzere oluşturduk. Bu eklentiler birlikte, kaynaklı kanıt getirmeyi, biyolojik yorumlamayı ve biyoinformatik yürütmeyi aynı çalışma alanına getirerek araştırmacıların, yapıtları ve köken bilgisini korurken dış kanıtları kurum içi omik analizleriyle bağlamasına yardımcı olur. Tüm kullanıcılar artık Codex üzerinden her iki eklentiye de erişebilir. Nitelikli GPT‑Rosalind kurumsal kullanıcıları ayrıca bu eklentileri çalıştırmak için GPT‑Rosalind’i kullanabilir.

Codex’ten bilim insanları için dinamik bir çalışma tezgâhı olarak daha iyi yararlanmak üzere, biyolojik olarak yerel dosya türleri için etkileşimli görüntüleyiciler ekledik. İlk dizi, hizalama ve yapı görüntüleyicileri; GPT‑Rosalind bir iş akışı boyunca akıl yürütürken bilim insanlarını kanıta yakın tutmak ve bağlam içinde aktif görüntüleyiciyi kullanarak takip sorularını doğrudan yanıtlamak için tasarlanmıştır.

Yukarıdaki demo, GPT‑Rosalind tarafından orkestre edilen bu yetenekleri uygulamada gösteriyor. Tedaviyi bilgilendirebilecek mutasyonları ve diğer moleküler değişiklikleri belirlemek için sıvı tümör biyopsisini araştıran bir bilim insanını izliyoruz. Life Sciences NGS Analysis eklentisi, işlenmiş ctDNA kayıtlarının incelemesini etkileşimli bir not defterine dönüştürerek tekrarlayan değişiklikleri, düşük frekanslı çağrıları ve araştırmayı KRAS G12C’ye odaklayan örnek yörüngelerini ortaya çıkarır. Buradan Life Sciences Research eklentisi kaynaklı hedef, inhibitör ve direnç bağlamı ekler; yerel sekans, hizalama ve yapı görüntüleyicileri ise bilim insanının mutant kalıntı 12’yi, RAS ailesi genelindeki korunmasını ve inhibitör bağlı cebi doğrudan incelemesine olanak tanır. İş akışı, her adım ve yapıt uzman incelemesine açık olacak şekilde, bu kanıtı somut takip seçeneklerine çevirerek sonuçlanır.

Bir bilgisayar ekranında, ctDNA mutasyon verilerini keşfetmek için NGS Analysis eklentisinin kullanılmasını söyleyen bir çalışma alanı gösteriliyor. Ekranda “En ayrıntılı histolojiler” ve “Mutasyona uğramış cfDNA örneklerine göre en çok değişen genler” etiketli, kanser türleri ve gen değişikliklerine ilişkin verileri gösteren birkaç çubuk grafik yer alıyor. Metin veri kümesini, temel bulguları ve analiz parametrelerini açıklıyor.

Life Sciences NGS Analysis eklentisi

scRNA-seq QC ve Açıklama

Bölünmüş ekranlı bir biyoinformatik iş akışının ekran görüntüsü. Sol panelde bir yapay zekâ asistanı, oluşturulan dosyalar, QC metrikleri, UMAP görselleştirmeleri ve hücre tipi açıklamaları dahil tamamlanmış tek hücre RNA dizileme (scRNA-seq) kalite kontrol analizini özetliyor. Sağ panelde toplam sayımlar, tespit edilen genler ve mitokondriyal yüzde için histogramların yanı sıra QC geçer/kalır sayımlarını ve filtrelenmiş hücre popülasyonlarını gösteren çubuk grafikler içeren bir “scRNA QC Review” raporu görüntüleniyor. Arayüz mavi-yeşil gradyan arka plan üzerinde gösteriliyor.

10x tarzı bir matris paketini Codex’te inceleyip revize edebileceğiniz QC filtreli tek hücre yapıtlarına, açıklamalara ve UMAP’lere dönüştürün. Life Sciences NGS Analysis eklentisi isteği scrna-seq-qc’ye yönlendirir, QC eşiklerini veriden seçer, filtreleme ve açıklama etrafındaki köken bilgisini korur ve eksik doublet tespit bağımlılıkları gibi engelleyicileri ortaya çıkarır.

Toplu RNA-seq FASTQ QC

RNA-seq iş akışının bölünmüş ekran görünümü: solda bir yapay zekâ asistanı tamamlanmış toplu RNA-seq kalite kontrol sonuçlarını özetlerken, sağda dizileme istatistikleri ve Salmon metrikleri içeren etkileşimli bir MultiQC raporu görüntüleniyor.

Toplu bir RNA-seq örnek sayfasını, FASTQ paketini ve referans dosyalarını Codex’te inceleyip yeniden kullanabileceğiniz QC’den geçmiş bir sayım paketine dönüştürün. Life Sciences NGS Analysis eklentisi isteği yönlendirir, girdileri doğrular ve MultiQC, Salmon matrisleri, köken bilgisi ve açık uyarılar içeren denetlenebilir bir çalıştırma zarfı döndürür.

Güvenilir kuruluşlar için genişletilmiş erişim

GPT‑Rosalind serisine erişimi dünya genelindeki uygun kuruluşlara genişletiyoruz. GPT‑Rosalind; açık kamu yararı olan meşru bilimsel araştırma yürüten, güçlü yönetişim ve güvenlik gözetimine sahip, kurumsal düzeyde güvenlikle kontrollü erişim sağlayan kuruluşlar için güvenilir erişim dağıtım yapımız üzerinden araştırma önizlemesi olarak sunulacaktır.

Bu küresel genişlemenin parçası olarak, Novo Nordisk’in tıbbi araştırmalarını GPT‑Rosalind ile ölçeklendirmesine yardımcı olarak yenilikçi tedavi seçeneklerini hastalara daha hızlı ulaştırma misyonunu desteklemekten heyecan duyuyoruz. Novo Nordisk, araştırmacıların karmaşık veri kümelerini analiz etmesine, yararlı örüntüleri ortaya çıkarmasına ve hipotezleri daha hızlı test etmesine yardımcı olmak için sınır yapay zekâ yeteneklerinden yararlanıyor. GPT‑Rosalind’in daha güçlü biyolojik anlayışı, ekiplerin literatür, genomik, transkriptomik, sekans, yapı ve deneysel sonuçlar arasındaki kanıtları bağlamasına yardımcı olarak veriden daha net araştırma kararlarına geçmeyi kolaylaştıracaktır.

“Yaşam bilimleri araştırması karmaşık, veri açısından zengin ve disiplinler arasıdır. Araştırmacılara anlamlı değer sunmak için gelişmiş yapay zekâ modelleri güvenilir bilimsel verilere dayanmalı, doğrulanmış araçlara bağlanmalı ve araştırmacıların her gün kullandığı gerçek dünya iş akışlarına entegre edilmelidir. OpenAI ile ortaklığımızdan ve GPT‑Rosalind’in ilaç keşfine yönelik daha titiz, pratik yaklaşımları nasıl destekleyebileceğini keşfetme fırsatından memnunuz.”

Mishal Patel, Grup Başkan Yardımcısı, AI ve Dijital İnovasyon, Ar-Ge - Novo Nordisk

Artık Enterprise hesabı olmayan nitelikli kuruluşlar için OpenAI tarafından yönetilen bir çalışma alanı da sunuyoruz.

Sırada ne var

Güncellenmiş GPT‑Rosalind, gelişmiş biyolojik yeteneklerin uygun korumalarla dağıtılmasını sağlarken bilimsel keşfi hızlandırmaya yardımcı olabilecek yapay zekâ sistemleri kurma konusundaki daha geniş taahhüdümüzde bir sonraki adımdır. Modelin biyolojik akıl yürütmesini iyileştirmeyi, araç ağırlıklı ve uzun ufuklu araştırma iş akışlarına desteği genişletmeyi ve gerçek dünya etkisini değerlendirmek için bölgeler genelinde nitelikli kuruluşlarla çalışmayı sürdüreceğiz.

Bu aynı zamanda yaşam bilimleri yapay zekâsını ilaç keşfi ve translasyonel tıptan halk sağlığı, hazırlık ve biyosavunmaya kadar yüksek etkili kamu yararı çalışmalarına uygulamak anlamına gelir. Rosalind Biodefense ve güvenilir erişim dağıtım modelimiz aracılığıyla, sınır biyolojik yetenekleri insan sağlığını iyileştirmek ve toplumsal dayanıklılığı güçlendirmek için çalışan araştırmacıların, kurumların ve savunucuların kullanımına sunmayı amaçlıyoruz.

Bilim insanlarının doğru sorulardan daha net kanıtlara, daha iyi deneylere ve nihayetinde hastalar için yeni tedavilere daha hızlı geçmesine yardımcı olarak, GPT‑Rosalind’i bilimsel araştırmanın tüm yaşam döngüsü boyunca daha yetenekli bir ortak haline getirmeyi sürdüreceğiz.