Life Sciences NGS Analysis
Dizileme analizi için yönlendirmeli NGS iş akışı seçimi ve yerel yürütme
- Yetenekler
- Interactive, Read, Write
- Kategori
- Eğitim
- Geliştirici
- OpenAI
- Web sitesi
- (yeni bir pencerede açılır)
Çalışma biçimi
Yeni nesil dizileme iş akışları için yönlendirmeli bilgi toplama, iş akışı seçimi ve yürütme eklentisi. Codex'in yerel dizileme girdilerini incelemesine, yalnızca deneye özgü eksik bilgileri sormasına, mümkünse herkese açık veya ücretsiz erişilebilen ve çalışma zamanında kurulabilen paketleri seçmesine, kurulumdan önce mevcut araçları denetlemesine ve desteklenen yerel iş akışlarını doğrulamalar, günlükler, manifestolar, QC raporları ve çıktı dizinleriyle yürütmesine yardımcı olur. BCL örnek ayrıştırma; FASTQ QC yürütme ve yorumlama; germ hattı, somatik ve UMI paneli DNA varyantları; toplu RNA-seq sayım üretimi ve diferansiyel ifade; ATAC-seq; ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag ve yerleşik sayım sonrası scRNA-seq QC için gelişmiş karar verme becerileri içerir.
Başka neler yapabilirsiniz?
Dizileme kalitesini değerlendirin
Yaşam Bilimleri NGS Analizi: Bu dizileme girdilerini incele ve analiz amacını netleştir. Desteklenen bir QC iş akışı seç, ön koşulları denetle ve tamamlanan raporları kaydedilmiş çıktılarla birlikte yorumla.
RNA dizileme analizini planlayın
Yaşam Bilimleri NGS Analizi: Bu toplu RNA-seq çalışmasının girdilerini ve tasarımını incele. Desteklenen bir analiz iş akışı öner, eksik meta verileri belirle ve yürütmeden önce gereken kontrolleri açıkla.
Dizileme sonuçlarını yorumlayın
Yaşam Bilimleri NGS Analizi: Tamamlanmış bu dizileme analizi çıktılarını incele. Kalite sorunlarını ve sonuçları özetle, bulguları varsayımlardan ayır ve destekleyici dosyalara atıfta bulun.
İçindeki uygulama ve özellikler
Beceri
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 tane daha
Kaynaklar
Life Sciences NGS Analysis eklentisini birkaç tıklamayla ekleyin
Kullanılabilirlik eklentiye, planınıza ve çalışma alanı ayarlarına bağlıdır. Bazı bağlantılar, yönetici kurulumu veya onayı gerektirir. Erişim engellenirse çalışma alanı yöneticinizle iletişime geçin.
İlgili eklentileri keşfedin
Data
Verileri net kararlara dönüştürün.
Life Sciences Literature
Biyomedikal makaleleri, ön baskıları ve açık erişimli tam metinleri bulun
NGS Analysis Workbench
Dizileme verilerini analiz edin
BioRender
Şekilleri bulun ve oluşturun
Documents
Belgeler oluşturun ve düzenleyin
Zotero
Zotero’dan makaleler bulun ve atıflar ekleyin
