Убрзавање откривања антибиотика уз ChatGPT
Др Сезар де ла Фуенте и његов тим користе нове алатке у борби против антимикробне резистенције.
„Невероватно је колико мало знамо и колико тога тек треба да откријемо. Трудим се да то пренесем младима, да схвате да будућност припада њима. О свету не знамо готово ништа — и то је узбудљиво, јер управо ту наука може да помогне.“ —др Сезар де ла Фуенте
„Алатке као што је ChatGPT помажу нам да убрзамо научна открића. За научника попут мене, то је право игралиште.“
Све већи проблем
Савремена медицина ослања се на ефикасне антибиотике, који нам помажу да се опоравимо од уобичајених болести, операција, порођаја и још много тога. Међутим, проблем постаје све већи: бактерије против којих се антибиотици боре веома су отпорне, а што више користимо антибиотике, то отпорни сојеви имају више прилика да постану доминантни. Ова појава је позната као антимикробна резистенција (AMR). Сваке године се око пет милиона смртних случајева повезује с бактеријском антимикробном резистенцијом, а очекује се да ће се тај број удвостручити до 2050.
Нови антибиотици су неопходни за борбу против антимикробне резистенције, али традиционални метод, у којем научници одлазе у природу и истражују земљиште, биљке и другу органску материју у потрази за активним молекулима, спор је и подразумева много покушаја и грешака. Алатке као што су ChatGPT и Codex омогућавају др Сезару де ла Фуентеу и његовом тиму да нове молекуле за борбу против антимикробне резистенције проналазе на нов и бржи начин. „Све радимо дигиталном брзином“, каже он.
„Често попијем једну шољицу кафе, а мој тим већ има мноштво новооткривених молекула од којих би могао настати следећи антибиотик.“
„Наша лабораторија преузима високоризичне пројекте, али када успемо, резултати су невероватни.“
—Марсело Дер Торосијан Торес
„Codex је одличан копилот. Када пожелим нешто да применим, Codex то може да направи за трен ока. Штеди ми време и омогућава ми да се бавим другим стварима.“
—Ерик Хартман
„За мене као експерименталног научника развој алгоритма представља огроман корак. Могу да користим Codex за писање скрипте и обезбедим да се моји подаци у сваком експерименту графички прикажу на исти начин.“
—Анђела Чезаро
Биологија као кôд
Једно од великих достигнућа лабораторије де ла Фуенте јесте то што је овом проблему приступила као проблему информација: ДНК, основа живота, само је кôд. Алатке као што је ChatGPT помажу тиму да осмисли алгоритме који могу брзо да претраже сложене системе што одређују наш свет и да за неколико сати, уместо за више година, пронађу нове кандидате за антибиотике.
„Сада можемо да откријемо нове молекуле антибиотика за неколико сати, уместо за пет или шест година.“
„Уз Codex, сада може да програмира и неко ко то никада раније није радио и ко не разуме језик рачунарства.“
—др Сезар де ла Фуенте
Анђела ради у експерименталној лабораторији и ствара молекуле за тестирање.
ChatGPT је постао неизоставан део начина рада лабораторије де ла Фуенте. „Постао је заједнички мозак лабораторије. Зна како различити чланови тима размишљају о науци јер у њега уносимо много својих идеја“, каже др де ла Фуенте. „Заиста одражава начин на који размишљамо: како стварамо идеје, нашу домишљатост и оно што ми као људи уносимо у рад.“
Codex је уклонио препреке међу члановима тима, од научника традиционалних усмерења до рачунарских биолога и инжењера машинског учења. „Људи који пре пет година никада не би користили рачунар ни за шта осим анализе података сада могу да се баве рачунарском биологијом. Могу да пишу алгоритме како би пронашли обрасце у својим подацима или да прикажу резултате на начине који раније нису били могући.“
„Наша лабораторија је веома разноврсна: имамо хемичаре, биологе и рачунарске научнике. Имамо много талентованих људи који раде у различитим областима.“
—Ђијанинг Бај
Приказ молекуларних структура које лабораторија де ла Фуенте претражује у великом обиму.
„Вештачка интелигенција може да повеже знања из различитих дисциплина и помогне нам да постављамо боља питања и развијамо боље методе за решавање заиста тешких проблема.“
—Тијананг Ленг
„Не бих радио свој посао како треба када не бисмо покушавали да решимо огромне проблеме.“
Будућност антибиотика
Спој људске домишљатости и машинске интелигенције помаже да се за медицину зацрта узбудљив пут напред. „До пре само неколико година био сам песимистичан у погледу наше способности да одржимо корак у трци између антимикробне резистенције и способности човечанства да ствара нове молекуле“, каже он. „Али сада ми неки од система које смо недавно развили помоћу алатки као што је ChatGPT дају много више наде него што сам очекивао.“ Све што др де ла Фуенте ради служи једном једином циљу: да се ублажи патња и спасу животи. „Цео живот чекам алатке које нам омогућавају да радимо оно што данас радимо.“
„Видели смо да многи молекули које смо открили заиста могу да униште савремене патогене.“
—др Сезар де ла Фуенте
„Замислите молекул који сте направили на рачунару, а који може да спасава животе. Мислим да научници живе за тренутке када открију нешто што нико у историји света није открио.“