OpenAI
Програмски додаци

Life Sciences NGS Analysis

Вођено усмеравање NGS анализе и локално извршавање анализе секвенцирања

Способности
Interactive, Read, Write
Категорија
Образовање
Програмер
OpenAI

Како то функционише

Програмски додатак за вођени пријем, усмеравање и извршавање радних токова секвенцирања нове генерације. Помаже систему Codex да прегледа локалне улазне податке секвенцирања, постави само питања специфична за тест на која недостају одговори, по могућности изабере јавне или бесплатно доступне пакете који се могу инсталирати током извршавања, провери доступност постојећих алата пре инсталације и изврши подржане локалне радне токове уз валидацију, евиденције, манифесте, извештаје о контроли квалитета и индексе артефаката. Обухвата напредне вештине одлучивања за демултиплексирање BCL података, извршавање и тумачење контроле квалитета FASTQ података, герминативне, соматске и варијанте ДНК у UMI панелима, генерисање бројева очитавања и анализу диференцијалне експресије за групно RNA-seq секвенцирање, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag и уграђену контролу квалитета scRNA-seq података након бројања.

Шта још можете да урадите?

  • Провера квалитета секвенцирања

    NGS анализа у природним наукама: прегледај ове улазне податке секвенцирања и разјасни циљ анализе. Изабери подржани ток контроле квалитета, провери предуслове и протумачи завршене извештаје уз сачуване артефакте.

  • Планирање анализе RNA секвенцирања

    NGS анализа у природним наукама: прегледај улазне податке и план ове студије групног RNA-seq секвенцирања. Препоручи подржани ток анализе, утврди који метаподаци недостају и објасни провере потребне пре извршавања.

  • Тумачење резултата секвенцирања

    NGS анализа у природним наукама: прегледај ове резултате завршене анализе секвенцирања. Сажми проблеме с квалитетом и резултате, одвоји налазе од претпоставки и наведи пратеће датотеке.

Шта је укључено

Вештина

  • Amplicon Microbiome
  • NGS Router
  • ATAC-seq Peaks QC
  • BCL to FASTQ
  • Bulk RNA-seq
  • Bulk RNA-seq Counts
  • Bulk RNA-seq DE
  • ChIP/CUT&RUN Peaks QC
  • Још 10

Ресурси

Додајте програмски додатак Life Sciences NGS Analysis у неколико кликова

Доступност зависи од програмског додатка, вашег плана и подешавања радног простора. Неке везе захтевају подешавање или одобрење администратора. Обратите се администратору свог радног простора ако је приступ блокиран.

Почни са додацима

Унесите податке и алате своје организације у OpenAI производе и убрзајте оно што ваши тимови могу да ураде.