Sari la conținutul principal
OpenAI

Prezentăm noi capabilități pentru GPT‑Rosalind

Aducem mai multă inteligență ancorată în fluxuri de lucru științifice reale pentru industria științelor vieții.

Prezentăm o nouă actualizare de model pentru seria noastră GPT‑Rosalind, creată special pentru cercetarea în științele vieții la scară de întreprindere. Aceasta combină capacitățile de codare agentivă și utilizare a instrumentelor ale GPT‑5.5 cu o inteligență de model mai puternică în domenii centrale ale descoperirii de medicamente, precum chimia medicinală și genomica, îmbunătățind totodată performanța în analiza, proiectarea și fluxurile experimentale mai ample din științele vieții.

Progresul în științele vieții depinde de sintetizarea datelor și dovezilor la diferite scări și în diverse modalități: molecule, gene, căi biologice și sisteme vii. În evaluările noastre, GPT‑Rosalind actualizat arată câștiguri ample de performanță la sarcini de cercetare de la experți în biologie, interogări complexe de chimie medicinală, biologie cantitativă și depanare în laborator umed.

GPT‑Rosalind este acum disponibil în previzualizare de cercetare pentru organizațiile eligibile la nivel global prin structura noastră de implementare cu acces de încredere.

Îmbunătățirea performanței la sarcini cu valoare științifică

Pentru a măsura și îmbunătăți continuu impactul real al GPT‑Rosalind, am proiectat LifeSciBench, un test evaluat extern de experți, axat pe aspecte fundamentale ale cercetării în științele vieții. Spre deosebire de testele existente, care evaluează izolat o singură componentă a performanței modelului sau un domeniu biologic, LifeSciBench adoptă o perspectivă completă asupra muncii cu valoare științifică, folosind sarcini din șase zone de flux de lucru esențiale pentru cercetarea în științele vieții: gestionarea dovezilor, analiza, proiectarea și optimizarea, raționamentul științific, validarea și operațiunile, precum și traducerea și comunicarea. Folosim acest benchmark pentru a alinia progresul cu nevoile și realitățile cercetării în științele vieții.

GPT‑Rosalind conduce performanța în sarcini cu valoare științifică identificate de experți din industrie și mediul academic.

Raționament științific mai puternic

Chimie medicinală

GPT‑Rosalind atinge performanțe de vârf în industrie în chimia medicinală, un domeniu axat pe transformarea moleculelor în medicamente utile. Am proiectat MedChemBench pentru a reflecta fluxuri de lucru realiste de chimie medicinală, evaluând înțelegerea multimodală a structurii chimice; relația structură-activitate (SAR); predicția potenței, toxicității și absorbției, distribuției, metabolismului și excreției (ADME) medicamentelor; luarea deciziilor multiparametrice de optimizare a compușilor principali; și retrosinteza. GPT‑Rosalind depășește GPT‑5.5 pe MedChemBench, cu 27,5% față de 25,1%, folosind în același timp cu 7,2% mai puține tokenuri.

GPT‑Rosalind arată sinteză multimodală și raționament mecanistic mai bune în chimia medicinală.

Genomică și biologie cantitativă

Pe GeneBench, evaluarea noastră agentivă pentru analiză end-to-end de lungă durată în genomică și biologie cantitativă, GPT‑Rosalind folosește cu 31% mai puține tokenuri decât GPT‑5.5, obținând totodată o acuratețe mai mare, de 21,6% față de 20,4%. GeneBench evaluează performanța agentivă în sarcini cantitative pe orizont lung: pe baza unor date științifice realiste, poate un agent să planifice analize valide, QC, modelare și corecții pentru a ajunge la răspunsuri relevante pentru decizie? Problemele incluse acoperă o varietate de domenii, inclusiv genomica funcțională, transcriptomica spațială, proteomica, epigenomica și genetica aplicată.

GPT‑Rosalind folosește cu 31% mai puține tokenuri decât GPT‑5.5, îmbunătățind totodată acuratețea.

Asistență pentru activitatea reală de laborator

Introducem o nouă evaluare pentru a testa capacitatea GPT‑Rosalind de a ajuta oamenii de știință care desfășoară activitate de laborator în lumea reală. LabWorkBench testează capacitatea modelului de a lega perturbările de rezultatele experimentale în protocoale reale de laborator umed folosite de oamenii de știință, în scopuri de la depanare la optimizare. Datele folosite de LabWorkBench sunt proprietare și, prin urmare, necontaminate. GPT‑Rosalind obține 63,2% față de 55,8% pentru GPT‑5.5, folosind cu 5,3% mai puține tokenuri.

În ceea ce privește asistența pentru protocoale reale de laborator, GPT‑Rosalind înregistrează îmbunătățiri semnificative față de GPT‑5.5, utilizând în același timp tokenuri mai eficient.

De la raționament la fluxuri de lucru executate

Am construit pluginurile Life Sciences Research(se deschide într-o fereastră nouă) și Life Sciences NGS Analysis(se deschide într-o fereastră nouă) pentru a extinde inteligența sporită a GPT‑Rosalind cu un strat practic de execuție pentru fluxuri de lucru științifice repetabile. Împreună, aceste pluginuri aduc recuperarea dovezilor cu surse, interpretarea biologică și execuția bioinformatică în același spațiu de lucru, ajutând cercetătorii să conecteze dovezile externe cu analizele omice interne, păstrând artefactele și proveniența. Toți utilizatorii pot accesa acum ambele pluginuri prin Codex. Utilizatorii enterprise GPT‑Rosalind calificați pot folosi suplimentar GPT‑Rosalind pentru a alimenta aceste pluginuri.

Pentru a valorifica mai bine Codex ca banc de lucru dinamic pentru oamenii de știință, am adăugat vizualizatoare interactive pentru tipuri de fișiere native biologic. Setul inițial de vizualizatoare pentru secvențe, alinieri și structuri este conceput pentru a menține oamenii de știință aproape de dovezi pe măsură ce GPT‑Rosalind raționează de-a lungul unui flux de lucru și răspunde direct la întrebări ulterioare folosind vizualizatorul activ în context.

Demonstrația de mai sus arată aceste capabilități în acțiune, orchestrate de GPT‑Rosalind. Urmărim un om de știință care investighează o biopsie lichidă tumorală pentru a identifica mutații și alte modificări moleculare care ar putea informa tratamentul. Pluginul Life Sciences NGS Analysis transformă o revizuire a înregistrărilor ctDNA procesate într-un notebook interactiv, evidențiind alterări recurente, apeluri cu frecvență joasă și traiectorii ale probelor care concentrează investigația pe KRAS G12C. De acolo, pluginul Life Sciences Research adaugă context cu surse despre țintă, inhibitor și rezistență, în timp ce vizualizatoarele native de secvențe, alinieri și structuri îi permit omului de știință să inspecteze direct reziduul mutant 12, conservarea sa în familia RAS și buzunarul de legare ocupat de inhibitor. Fluxul de lucru se încheie prin traducerea acelor dovezi în opțiuni concrete de urmărire, fiecare pas și artefact fiind disponibil pentru revizuire de către experți.

Un ecran de computer arată un spațiu de lucru care indică utilizarea unui plugin NGS Analysis pentru explorarea datelor de mutații ctDNA. Ecranul include mai multe grafice cu bare etichetate „Top histologii detaliate” și „Top gene alterate după probe cfDNA mutate”, afișând date despre tipuri de cancer și alterări genetice. Textul descrie setul de date, constatările-cheie și parametrii de analiză.

Plugin Life Sciences NGS Analysis

QC și adnotare scRNA-seq

Captură de ecran a unui flux de lucru bioinformatic pe ecran împărțit. Panoul din stânga arată un asistent AI care rezumă o analiză de control al calității finalizată pentru secvențiere ARN la nivel de celulă unică (scRNA-seq), inclusiv fișiere generate, metrici QC, vizualizări UMAP și adnotări ale tipurilor celulare. Panoul din dreapta afișează un raport „Evaluare QC scRNA” cu histograme pentru număr total de citiri, gene detectate și procent mitocondrial, alături de grafice cu bare care arată numărul de treceri/eșecuri QC și populațiile celulare filtrate. Interfața este afișată pe un fundal cu gradient albastru-verde.

Transformă un pachet de matrice în stil 10x în artefacte single-cell filtrate QC, adnotări și UMAP-uri pe care le poți inspecta și revizui în Codex. Pluginul Life Sciences NGS Analysis direcționează solicitarea către scrna-seq-qc, alege praguri QC din date, păstrează proveniența filtrării și adnotării și evidențiază blocaje precum dependențele lipsă pentru detectarea dubletelor.

QC FASTQ pentru RNA-seq bulk

Vizualizare pe ecran împărțit a unui flux de lucru RNA-seq: un asistent AI rezumă în stânga rezultatele finalizate ale controlului calității pentru RNA-seq bulk, în timp ce în dreapta este afișat un raport interactiv MultiQC cu statistici de secvențiere și metrici Salmon.

Transformă o fișă de probe RNA-seq bulk, un pachet FASTQ și fișiere de referință într-un pachet de conturi revizuit QC, pe care îl poți inspecta și reutiliza în Codex. Pluginul Life Sciences NGS Analysis direcționează solicitarea, validează intrările și returnează un pachet de rulare auditabil cu MultiQC, matrice Salmon, proveniență și avertismente explicite.

Acces extins pentru organizații de încredere

Extindem accesul la seria GPT‑Rosalind pentru organizațiile eligibile la nivel global. GPT‑Rosalind va fi disponibil în previzualizare de cercetare prin structura noastră de implementare cu acces de încredere pentru organizațiile care desfășoară cercetare științifică legitimă cu beneficii publice clare, au guvernanță solidă și supraveghere a siguranței, precum și acces controlat cu securitate de nivel enterprise.

Ca parte a acestei extinderi globale, suntem încântați să sprijinim misiunea Novo Nordisk de a aduce mai rapid pacienților opțiuni de tratament inovatoare, ajutând la scalarea cercetării lor medicale cu GPT‑Rosalind. Novo Nordisk valorifică capabilități AI de frontieră pentru a ajuta cercetătorii să analizeze seturi de date complexe, să descopere tipare utile și să testeze ipoteze mai rapid. Înțelegerea biologică mai puternică a GPT‑Rosalind va ajuta echipele să conecteze dovezi din literatură, genomică, transcriptomică, secvențe, structuri și rezultate experimentale, facilitând trecerea de la date la decizii de cercetare mai clare.

„Cercetarea în științele vieții este complexă, bogată în date și interdisciplinară. Pentru a oferi valoare semnificativă cercetătorilor, modelele AI avansate trebuie să fie ancorate în date științifice de încredere, conectate la instrumente validate și integrate în fluxurile de lucru reale pe care cercetătorii le folosesc zilnic. Suntem mulțumiți de parteneriatul nostru cu OpenAI și de oportunitatea de a explora modul în care GPT‑Rosalind poate susține abordări mai riguroase și practice ale descoperirii de medicamente.”

Mishal Patel, Vicepreședinte de grup, AI și inovație digitală, R&D - Novo Nordisk

Oferim acum și un spațiu de lucru gestionat de OpenAI pentru organizațiile calificate fără cont Enterprise.

Ce urmează

GPT‑Rosalind actualizat este următorul pas în angajamentul nostru mai amplu de a construi sisteme AI care pot ajuta la accelerarea descoperirii științifice, asigurând în același timp că capabilitățile biologice avansate sunt implementate cu garanții adecvate. Vom continua să îmbunătățim raționamentul biologic al modelului, să extindem suportul pentru fluxuri de lucru de cercetare intensive în instrumente și pe orizont lung și să colaborăm cu organizații calificate din diverse regiuni pentru a evalua impactul în lumea reală.

Aceasta înseamnă și aplicarea AI pentru științele vieții în activități cu impact mare și beneficiu public, de la descoperirea de medicamente și medicina translațională până la sănătate publică, pregătire și apărare biologică. Prin Rosalind Biodefense și modelul nostru de implementare cu acces de încredere, ne propunem să punem capabilități biologice de frontieră în mâinile cercetătorilor, instituțiilor și apărătorilor care lucrează pentru a îmbunătăți sănătatea umană și a întări reziliența societății.

Vom continua să dezvoltăm GPT‑Rosalind pentru a deveni un partener mai capabil pe întregul ciclu de viață al cercetării științifice, ajutând oamenii de știință să treacă mai rapid de la întrebările potrivite la dovezi mai clare, experimente mai bune și, în cele din urmă, tratamente noi pentru pacienți.