मुख्य मजकूराकडे जा
OpenAI

GPT‑Rosalind साठी नवीन क्षमता सादर करत आहोत

जीवनविज्ञान उद्योगासाठी वास्तविक वैज्ञानिक वर्कफ्लोमध्ये आधारलेली अधिक बुद्धिमत्ता आणत आहे.

आम्ही जीवन विज्ञान संशोधनासाठी एंटरप्राइझ स्तरावर खास विकसित केलेल्या GPT‑Rosalind मालिकेतील नवीन मॉडेल अद्यतन सादर करत आहोत. हे मॉडेल GPT‑5.5 च्या एजंटीक कोडिंग आणि साधन-वापर क्षमतांना औषध शोध क्षेत्रातील मुख्य विभागांमध्ये, जसे की औषधी रसायनशास्त्र आणि जीनोमिक्स, अधिक प्रगत बुद्धिमत्तेसह एकत्रित करते. तसेच, जीवन विज्ञानातील विश्लेषण, डिझाइन आणि प्रायोगिक कार्यप्रवाहांच्या व्यापक क्षेत्रांमध्येही कार्यक्षमता वाढवते.

जीवन विज्ञानातील प्रगती विविध स्तरांवरील आणि प्रकारांतील डेटा व पुरावे एकत्रितपणे समजून घेण्यावर अवलंबून असते—जसे की रेणू, जीन्स, जैविक मार्ग आणि सजीव प्रणाली. आमच्या मूल्यमापनांमध्ये, अद्ययावत GPT‑Rosalind ने जीवशास्त्र तज्ज्ञांनी तयार केलेल्या संशोधन कार्यांमध्ये, जटिल औषधी रसायनशास्त्राशी संबंधित प्रश्नांमध्ये, परिमाणात्मक जीवशास्त्र आणि प्रयोगशाळेतील समस्यानिवारणामध्ये व्यापक कार्यक्षमता सुधारणा दर्शविली आहे.

GPT‑Rosalind आता आमच्या विश्वसनीय-अॅक्सेस डिप्लॉयमेंट संरचनेद्वारे जागतिक स्तरावर पात्र संस्थांना संशोधन पूर्वावलोकनात उपलब्ध आहे.

वैज्ञानिकदृष्ट्या मौल्यवान कार्यांवरील कार्यप्रदर्शन सुधारणे

GPT‑Rosalind चा वास्तविक जीवनातील प्रभाव मोजण्यासाठी आणि सातत्याने सुधारण्यासाठी, आम्ही LifeSciBench हा बाह्य तज्ज्ञांकडून मूल्यमापन केला जाणारा बेंचमार्क विकसित केला आहे, जो जीवन विज्ञान संशोधनातील मूलभूत पैलूंवर केंद्रित आहे. विद्यमान बेंचमार्क्स सहसा मॉडेलच्या कार्यक्षमतेच्या एखाद्या एकाच घटकाचे किंवा जैविक क्षेत्राचे स्वतंत्रपणे मूल्यांकन करतात; परंतु LifeSciBench वैज्ञानिकदृष्ट्या उपयुक्त कार्याचे संपूर्ण मूल्यांकन करते. यासाठी जीवन विज्ञान संशोधनातील सहा महत्त्वाच्या कार्यप्रवाह क्षेत्रांमधून कार्ये निवडली जातात: पुरावा हाताळणी, विश्लेषण, रचना व अनुकूलन, वैज्ञानिक रीझनिंग, प्रमाणीकरण व कार्यवाही, तसेच रूपांतरण व संवाद. जीवन विज्ञान संशोधनाच्या गरजा आणि प्रत्यक्ष परिस्थितींशी प्रगती सुसंगत राहावी यासाठी आम्ही या बेंचमार्कचा वापर करतो.

GPT‑Rosalind हे उद्योग आणि शैक्षणिक क्षेत्रातील तज्ञांनी निश्चित केलेल्या, वैज्ञानिकदृष्ट्या महत्त्वपूर्ण असलेल्या कार्यांमध्ये कामगिरीच्या बाबतीत आघाडीवर आहे.

पेपर, आकृत्या, तक्ते आणि प्रयोगात्मक नोंदींमधून वैज्ञानिक पुरावे काढणे, जुळवणे आणि ऑडिट करणे.

मुल्यांकन उदाहरण

We’re preparing for a Type B FDA meeting on AAV9-microDys-X, an AAV9-based micro-dystrophin gene therapy for Duchenne muscular dystrophy that expresses a 138 kDa construct from an MCK promoter, and we want a hard-nosed critique of whether our current package really supports accelerated approval on micro-dystrophin expression as a surrogate endpoint reasonably likely to predict clinical benefit.

Study context: open-label Phase 1b/2 in 12 ambulatory boys age 4–7 with confirmed DMD and out-of-frame rod-domain deletions. The package is:

  • Pre-treatment vastus lateralis biopsies: 0–3% of healthy-control dystrophin by quantitative Western blot using MANEX1A against the N-terminal actin-binding domain.
  • 12-week post-treatment contralateral vastus lateralis biopsies: mean micro-dystrophin 38% of healthy control (range 18–61%) by the same Western blot, normalized to total protein by Coomassie staining.
  • Post-treatment immunofluorescence: sarcolemmal signal in 75–95% of fibers using a polyclonal anti-dystrophin C-terminal antibody.
  • 48-week function: mean NSAA change +1.4 points from baseline versus −0.6 in an external published natural-history registry cohort (p = 0.03 by unpaired t-test).
  • Safety: transient transaminitis in 8/12 patients managed with steroid taper; one resolved myocarditis; no deaths.
  • Biodistribution/persistence: AAV9 vector genomes detectable in muscle at 12 weeks at a mean of 2.3 vector genomes per nucleus.
  • Eligibility: no baseline anti-AAV9 neutralizing antibodies (titer <1:400) and no exon-44 deletions.

Please pressure-test this package item by item: where would FDA or a skeptical reviewer say the evidence, as presented, fails to support our conclusion, and what additional data, analyses, or design changes would be needed to close those gaps if possible? For anything not specified, assume what is known from other clinical-grade 138 kDa micro-dystrophin programs and relevant clinical trials through December 31, 2025 also applies.

उमेदवार प्रतिसाद

तळाची ओळ: सादर केल्याप्रमाणे, क्लिनिकल फायद्याचा वाजवीपणे अंदाज लावण्याची शक्यता असलेला एक पर्यायी एंडपॉइंट म्हणून मायक्रो-डिस्ट्रोफिन अभिव्यक्तीच्या जलद मंजुरीची हमी देण्यासाठी हे पॅकेज पुरेसे मजबूत नाही. एक साशंक FDA समीक्षक बायोमार्कर, कार्यात्मक, टिकाऊपणा, सुरक्षितता आणि सामान्यीकरणक्षमतेचे पुरावे मोठ्या प्रमाणात अपुरे असल्याचे मानण्याची शक्यता आहे.

पॅकेज घटक

मुख्य अपयश प्रकार

काय आवश्यक असेल

वेस्टर्न ब्लॉटचे परिमाणीकरण

MANEX1A हे अंतर्जात पूर्ण-लांबीच्या डिस्ट्रोफिनमध्ये आणि मायक्रो-डिस्ट्रोफिन ट्रान्सजीनमध्ये सामायिक असलेल्या N-टर्मिनल एपिटोपशी बाइंड होते; त्यामुळे, ही चाचणी ट्रान्सजीन आणि अवशिष्ट/रिव्हर्टंट डिस्ट्रोफिन यांच्यात स्पष्टपणे फरक करू शकत नाही. निरोगी, पूर्ण-लांबीच्या डिस्ट्रोफिनच्या मानकाचा आधार घेऊन 138 kDa च्या मायक्रो-डिस्ट्रोफिनचे प्रमाण निश्चित करणे हे देखील अशास्त्रीय ठरते.

पुनर्संयोजित मायक्रो-डिस्ट्रोफिन मानक आणि ट्रान्सजीनला अंतर्जात डिस्ट्रोफिनपासून वेगळे करणारी ऑर्थोगोनल पद्धत वापरा, जसे की लक्ष्यित मास स्पेक्ट्रोमेट्री किंवा ट्रान्सजीन-विशिष्ट/एपिटोप-विशिष्ट चाचणी.

इम्युनोफ्लोरोसन्स

C-टर्मिनल पॉलीक्लोनल अँटीबॉडी फारशी उपयुक्त नाही, कारण 138 kDa रचनेत सी-टर्मिनल डोमेनचा अभाव असतो. अनेक डीएमडी रुग्णांमध्ये रिव्हर्टंट फायबर्स असतात आणि रिव्हर्टंट डायस्ट्रोफिन C-टर्मिनल एपिटोप्स टिकवून ठेवू शकते. वयानुसार रिव्हर्टंट फायबर्सचा क्लोनल विस्तार होऊ शकतो, ज्यामुळे आयएफ सिग्नलमध्ये बदल होतो, विशेषतः मोठ्या मुलांमध्ये.

ट्रान्सजीनमध्ये उपस्थित असलेल्या परंतु रिव्हर्टंट डायस्ट्रोफिनमध्ये अनुपस्थित असलेल्या एपिटोपच्या विरुद्ध अँटीबॉडी वापरून IF ची पुनरावृत्ती करा. ट्रान्सजीन-पॉझिटिव्ह फायबर्सची संख्या रिव्हर्टंट फायबर्सपासून वेगळी मोजा.

प्रतिनिधी एंडपॉइंट वैधता

या पॅकेजमध्ये प्रथिनांचे प्रमाण आणि त्यांचे वैद्यकीय कार्य यांची गल्लत करण्यात आली आहे. "निरोगी-नियंत्रण गटातील प्रथिनांच्या वस्तुमानापैकी 38%" असण्याचा अर्थ, डायस्ट्रोफिनचे सामान्य कार्य 38% इतके असणे असा होत नाही; कारण 'मायक्रो-डायस्ट्रोफिन' हे रचनेच्या दृष्टीने खंडित असते.

अभिव्यक्तीला एक पर्यायी एंडपॉइंट मानण्यापूर्वी, मायक्रो-डिस्ट्रोफिन वस्तुमान-टक्केवारी, सार्कोलेमल स्थानिकीकरण, डाउनस्ट्रीम कार्यात्मक पुनर्संचयन आणि क्लिनिकल लाभ यांच्यातील संबंध प्रायोगिकरित्या प्रमाणित करा.

बायोप्सी रचना

उपचारापूर्वी आणि उपचारानंतर घेतलेल्या कॉन्ट्रालॅटरल व्हॅस्टस लॅटरॅलिस बायोप्सीमुळे डावी-उजवी आणि स्नायूअंतर्गत अवकाशीय भिन्नता निर्माण होते. रोगाची वाढ आणि फायब्रो-फॅटी रिप्लेसमेंटमुळे एकूण-प्रथिन-सामान्यीकृत सिग्नलमध्येही बदल होऊ शकतो.

सुसंगत शरीरशास्त्रीय खुणांचा वापर करून बायोप्सीचे ठिकाण प्रमाणित करा, स्नायू-विशिष्ट प्रथिनांच्या संदर्भात त्याचे सामान्यीकरण करा आणि समांतरपणे तंतु-मेद रचनेचे मापन करा.

NSAA कॉम्पॅरेटर/सांख्यिकी

बाह्य नैसर्गिक-इतिहास समूह हा यादृच्छिक समवर्ती नियंत्रण गट नसतो. चाचणीसाठीची पात्रता, आधारभूत काळजी, सहभागाचे परिणाम, आधारभूत NSAA, स्टिरॉइड उपचारपद्धती, वय आणि एक्सॉन वर्ग या सर्वांमुळे तुलनेत पक्षपात होऊ शकतो. एक अनपेअर्ड T-टेस्ट पुरेशी नाही. तसेच, या वयोगटासाठी +1.4 NSAA बदल हा टेस्ट-रीटेस्ट व्हेरिएबिलिटीच्या मर्यादेत आहे.

एक यादृच्छिक, समवर्ती आणि प्लासिबो-नियंत्रित अभ्यास राबवा; किंवा किमानपक्षी, आधारभूत NSAA गुण, वय, स्टिरॉइड उपचार पद्धती, exon वर्ग आणि इतर संभ्रमित घटकांचा विचार करणारे समायोजित विश्लेषण वापरा.

वयोगट-संभ्रम

वय 4–7 वयोगटातील मुले विकासाच्या अशा टप्प्यावर असतात, जिथे उपचार न घेतलेले चालण्याफिरण्यास सक्षम असलेले DMD रुग्ण, शारीरिक क्षमतेत घट होण्यापूर्वी मोटर कार्यक्षमता मिळवू शकतात. 48-आठवड्यांच्या NSAA बदलामध्ये विकासात्मक प्रगती, रोगाची वाढ आणि उपचारांचा संभाव्य परिणाम यांचा मिलाफ दिसून येतो.

उपचाराच्या परिणामापासून विकासात्मक मार्ग वेगळा करण्यासाठी, वयोगटानुसार वर्गीकरणासह समवर्ती यादृच्छिक नियंत्रणाचा वापर करा.

मागील वैद्यकीय पूर्वदृष्टांत

ओपन-लेबल मायक्रो-डिस्ट्रोफिन कार्यात्मक संकेतांनी पुष्टीकारक लाभाचा विश्वसनीयपणे अंदाज वर्तवलेला नाही; प्रकाशित उदाहरणांमध्ये मायक्रो-डिस्ट्रोफिन जीन थेरपीच्या पुष्टीकारक चाचण्यांचा समावेश आहे, ज्या ओपन-लेबल NSAA सुधारणांची पुनरावृत्ती करण्यात अयशस्वी ठरल्या.

'ओपन-लेबल NSAA बदलावर' निर्णायक आधार म्हणून अवलंबून राहू नका. नियंत्रित कार्यात्मक पुराव्याची मागणी करा.

संकल्पनेच्या संरचनात्मक मर्यादा

138 kDa रचना स्पेक्ट्रिन रिपीट 16/17 काढून टाकते, ज्यात एनएनओएस-बाइंडिंग साइट्स असतात. एनएनओएस रिक्रूटमेंटच्या अभावामुळे व्यायामादरम्यान कार्यात्मक सिम्पॅथोलिसिस आणि इस्केमियापासून संरक्षणात अडथळा येऊ शकतो, ज्यामुळे अभिव्यक्ती पातळीपासून स्वतंत्रपणे बचावावर एक यांत्रिक मर्यादा निर्माण होते.

हा विशिष्ट रचना-घटक संबंधित डिस्ट्रोफिन-संलग्न संकुलाचे कार्य, nNOS चे स्थानिकीकरण, व्यायाम-शरीरक्रियाशास्त्र आणि स्नायूंचे संरक्षण पूर्ववत करतो की नाही, हे दर्शवणारे यांत्रिक अभ्यास यामध्ये समाविष्ट करा.

AAV ची टिकाऊपणा

12 आठवड्यांनंतर व्हेक्टर जीनोममध्ये टिकाऊ अभिव्यक्ती स्थापित होत नाही. AAV9 जीनोम हे बहुतांशी नॉन-इंटीग्रेटिंग एपिसोम्स असतात आणि कालांतराने ते कमी होऊ शकतात. व्हेक्टर-जीनोमचे टिकून राहणे हे प्रथिनांच्या सातत्यपूर्ण अभिव्यक्तीसारखे नसते.

12 आठवड्यांच्या पलीकडे अनुदैर्ध्य ट्रान्सजीन प्रथिन अभिव्यक्ती आणि कार्यात्मक जैव-निर्देशकांची टिकाऊपणा मोजा.

रोगप्रतिकारक/सुरक्षा स्वरूप

8/12 रुग्णांमधील ट्रान्सअमायनायटिस हे AAV-ट्रान्सड्यूस्ड पेशींवरील रोगप्रतिकारक प्रतिसादाशी सुसंगत आहे, परंतु त्याची यंत्रणा अद्याप स्थापित झालेली नाही. AAV9 चा हृदयाकडे असलेला कल पाहता, मायोकार्डायटिसचे एक प्रकरण चिंताजनक आहे.

अधिक सखोल रोगप्रतिकारक निरीक्षण, यकृत व हृदयाच्या सुरक्षिततेचे वैशिष्ट्य-निर्धारण आणि हृदयाशी संबंधित अधिक तीव्र पाठपुरावा उपलब्ध करून द्या.

रुग्णांची निवड / सामान्यीकरणक्षमता

अँटी-AAV9 न्यूट्रलायझिंग-अँटीबॉडी-पॉझिटिव्ह रुग्णांना वगळल्यामुळे सामान्यीकरण मर्यादित होते. एक्सॉन-44 डिलीशन्स वगळल्यामुळे त्या DMD उपसमूहासाठी उपयोज्यता मर्यादित होते. व्यापक DMD लोकसंख्येमध्ये सुरक्षितता आणि परिणामकारकता यांचे वैशिष्ट्य दर्शवण्यासाठी n=12 ही संख्या खूपच लहान आहे.

व्यापक मंजुरीसाठी निकालाचा आधार घेण्यापूर्वी, शक्य असेल तिथे पात्रतेचा विस्तार करा किंवा अँटीबॉडी स्थिती, जीनोटाइप/एक्झॉन वर्ग, वय आणि बेसलाइन फंक्शननुसार स्तरीकृत विश्लेषणे पूर्वनिर्दिष्ट करा.

नियामक निष्कर्ष: हे पॅकेज जैविक क्रियाशीलता दर्शवू शकते, परंतु मोजलेली मायक्रो-डिस्ट्रोफिन अभिव्यक्ती ही नैदानिक लाभाचा वाजवीपणे अंदाज वर्तवण्यासाठी एक विश्वसनीय पर्याय आहे, हे अद्याप सिद्ध होत नाही. मुख्य उणिवा म्हणजे चाचणीची विशिष्टता, अवैध परिमाणीकरण मानके, रिव्हर्टंट-फायबरमुळे होणारा संभाव्य गोंधळ, यादृच्छिक नियंत्रणाचा अभाव, वयाशी संबंधित NSAA मुळे होणारा गोंधळ, अनिश्चित टिकाऊपणा आणि न सुटलेले सुरक्षितता/सामान्यीकरणाचे मुद्दे.

ही तफावत भरून काढण्यासाठी, कार्यक्रमाला एका नियंत्रित, वयोगटानुसार वर्गीकृत क्लिनिकल डिझाइनची आवश्यकता असेल, ज्यामध्ये ट्रान्सजीन-विशिष्ट अभिव्यक्ती चाचण्या, ऑर्थोगोनल प्रोटीन प्रमाणीकरण, ऊती-रचना नियंत्रणे, दीर्घकालीन टिकाऊपणा डेटा, ट्रंकेटेड कन्स्ट्रक्टसाठी मेकॅनिस्टिक कार्यात्मक चाचण्या आणि अधिक मजबूत सुरक्षा देखरेख, विशेषतः यकृत आणि हृदयाशी संबंधित, यांचा समावेश असेल.

रुब्रिक निकष आणि ग्रेड्स

निकष
गुण
Identifies assay/measurement problems in micro-dystrophin quantification, including MANEX1A epitope sharing, invalid full-length dystrophin standards, and need for recombinant or orthogonal transgene-specific measurement.
+24
Explains why micro-dystrophin expression level is not automatically a valid surrogate for functional clinical benefit.
+22
Flags biopsy-site, tissue-composition, and age-window confounding that weaken expression and NSAA interpretation.
+19
Critiques the NSAA comparator/statistics, especially reliance on external natural-history controls.
+12
Addresses AAV durability, immune response, transaminitis, myocarditis, and need for longer-term expression/safety follow-up.
+15
Notes patient-selection/generalizability gaps, including anti-AAV9 exclusion, exon-44 exclusion, and small sample size.
+8

अधिक मजबूत वैज्ञानिक रीझनिंग

औषधी रसायनशास्त्र

GPT‑Rosalind औषधी रसायनशास्त्रामध्ये उद्योग-अग्रणी कामगिरी करते, जे रेणूंना उपयुक्त औषधांमध्ये रूपांतरित करण्यावर लक्ष केंद्रित करणारे क्षेत्र आहे. आम्ही MedChemBench ची रचना वास्तववादी औषधी रसायनशास्त्राच्या कार्यप्रवाहांना प्रतिबिंबित करण्यासाठी केली आहे, जे बहुविध रासायनिक संरचना आकलन; संरचना-क्रियाकलाप संबंध (SAR); औषधाची क्षमता, विषारीपणा आणि शोषण, वितरण, चयापचय, उत्सर्जन (ADME) यांचे भाकीत; बहु-मापदंडीय लीड-ऑप्टिमायझेशन निर्णय-प्रक्रिया; आणि रेट्रोसिंथेसिस यांचे मूल्यांकन करते. MedChemBench वर GPT‑Rosalind, GPT‑5.5 पेक्षा 27.5% विरुद्ध 25.1% अशी उत्कृष्ट कामगिरी करते, आणि तेही 7.2% कमी टोकन्स वापरून.

GPT‑Rosalind औषधी रसायनशास्त्रात उत्तम मल्टीमोडल रीझनिंग आणि यांत्रिक तर्क दाखवते.

जीनोमिक्स आणि परिमाणात्मक जीवशास्त्र

GeneBench आणि परिमाणात्मक जीवशास्त्रातील दीर्घकालीन आणि संपूर्ण विश्लेषणासाठी तयार केलेल्या आमच्या एजेंटिक मूल्यमापन बेंचमार्क GeneBench वर, GPT‑Rosalind ने GPT‑5.5 च्या तुलनेत 31% कमी टोकन्स वापरले, तसेच 20.4% च्या तुलनेत 21.6% अशी अधिक अचूकता प्राप्त केली. GeneBench दीर्घकालीन परिमाणात्मक कार्यांमध्ये एजेंटिक कार्यक्षमतेचे मूल्यमापन करते. वास्तविक वैज्ञानिक डेटाच्या आधारे, एखादा एजंट वैध विश्लेषण, QC, मॉडेलिंग आणि आवश्यक सुधारणा करून निर्णयासाठी उपयुक्त उत्तरांपर्यंत पोहोचू शकतो का? हे यात तपासले जाते. या बेंचमार्कमध्ये कार्यात्मक जीनोमिक्स , स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स , प्रोटिओमिक्स, एपिजीनोमिक्स आणि अनुप्रयुक्त आनुवंशशास्त्र यांसह विविध क्षेत्रांतील समस्या समाविष्ट आहेत.

GPT‑Rosalind अचूकता सुधारताना GPT‑5.5 पेक्षा 31% कमी टोकन वापरते.

प्रत्यक्ष लॅब कामात सहाय्य

वास्तविक प्रयोगशाळेतील काम करणाऱ्या वैज्ञानिकांना मदत करण्याच्या GPT‑Rosalind च्या क्षमतेचे मूल्यमापन करण्यासाठी आम्ही एक नवीन मूल्यांकन पद्धती सादर करत आहोत. LabWorkBench वैज्ञानिकांकडून वापरल्या जाणाऱ्या प्रत्यक्ष वेट-लॅब प्रोटोकॉलमध्ये हस्तक्षेप आणि प्रायोगिक परिणाम यांच्यातील संबंध ओळखण्याची मॉडेलची क्षमता तपासते. या चाचणीचा उपयोग समस्यानिवारण ते अनुकूलन अशा विविध उद्देशांसाठी केला जातो. LabWorkBench मध्ये वापरला जाणारा डेटा मालकीहक्काचा असल्यामुळे तो प्रशिक्षण डेटामधून दूषित झालेला नाही. या मूल्यांकनात GPT‑Rosalind ने 63.2% गुण मिळवले, तर GPT‑5.5 ने 55.8% गुण मिळवले; तसेच GPT‑Rosalind ने 5.3% कमी टोकन्स वापरले.

प्रत्यक्ष वेट लॅब प्रोटोकॉल सहाय्यात, GPT‑Rosalind GPT‑5.5 पेक्षा लक्षणीय प्रगती दाखवते आणि टोकन कार्यक्षमता सुधारते.

रीझनिंगपासून अंमलात आणलेल्या वर्कफ्लोकडे

पुनरावृत्ती करण्यायोग्य वैज्ञानिक कार्यप्रवाहांसाठी एका व्यावहारिक अंमलबजावणी स्तरासह GPT‑Rosalind ची वाढीव बुद्धिमत्ता वाढवण्यासाठी आम्ही Life Sciences Research(नवीन विंडोमध्ये उघडेल) आणि Life Sciences NGS Analysis(नवीन विंडोमध्ये उघडेल) हे प्लगइन्स तयार केले आहेत. एकत्रितपणे, हे प्लगइन्स स्रोताद्वारे पुरावे मिळवणे, जैविक अर्थ लावणे आणि बायोइन्फॉर्मेटिक्सची अंमलबजावणी या सर्वांना एकाच वर्कस्पेस आणतात, ज्यामुळे संशोधकांना आर्टिफॅक्ट्स आणि मूळ स्रोत जतन करून बाह्य पुरावे अंतर्गत ओमिक्स विश्लेषणांशी जोडण्यास मदत होते. आता सर्व वापरकर्ते Codex द्वारे दोन्ही प्लगइन्स वापरू शकतात. पात्र GPT‑Rosalind एंटरप्राइझ वापरकर्ते या प्लगइन्सना चालना देण्यासाठी GPT‑Rosalind चा वापर देखील करू शकतात.

वैज्ञानिकांसाठी गतिशील वर्कबेंच म्हणून Codex चा अधिक चांगला वापर करण्यासाठी, आम्ही जैविकदृष्ट्या मूळ फाइल प्रकारांसाठी परस्परसंवादी व्ह्यूअर्स जोडले. सीक्वेन्स, अलाइनमेंट आणि संरचना व्ह्यूअर्सचा प्रारंभिक संच वैज्ञानिकांना पुराव्याजवळ ठेवण्यासाठी डिझाइन केला आहे, जेव्हा GPT‑Rosalind वर्कफ्लोभर रीझनिंग करते आणि सक्रिय व्ह्यूअर इन-कॉन्टेक्स्ट वापरून फॉलो-अप प्रश्नांना थेट उत्तर देते.

वरील डेमोमध्ये GPT‑Rosalind द्वारे नियंत्रित केलेल्या या क्षमता प्रत्यक्ष कृतीत दाखवल्या आहेत. आपण एका शास्त्रज्ञाला पाहतो जो उपचारांसाठी उपयुक्त ठरू शकणारे उत्परिवर्तन आणि इतर आण्विक बदल ओळखण्यासाठी लिक्विड ट्यूमर बायोप्सीची तपासणी करत आहे. लाइफ सायन्सेस NGS ॲनालिसिस प्लगइन, प्रक्रिया केलेल्या ctDNA रेकॉर्ड्सच्या पुनरावलोकनाला एका इंटरॲक्टिव्ह नोटबुकमध्ये रूपांतरित करते, जे वारंवार होणारे बदल, कमी वारंवारतेचे कॉल्स आणि नमुन्यांचे मार्ग समोर आणते, ज्यामुळे तपासणी KRAS G12C वर केंद्रित होते. तिथून पुढे, लाइफ सायन्सेस रिसर्च प्लगइन स्रोताद्वारे मिळवलेले लक्ष्य, अवरोधक आणि प्रतिकार संदर्भ जोडते, तर नेटिव्ह सिक्वेन्स, अलाइनमेंट आणि स्ट्रक्चर व्ह्यूअर्स शास्त्रज्ञाला उत्परिवर्तित अवशेष 12, RAS फॅमिलीमधील त्याचे संवर्धन आणि अवरोधकाशी जोडलेले पॉकेट थेट तपासण्याची परवानगी देतात. ही कार्यप्रणाली त्या पुराव्याचे ठोस पुढील पर्यायांमध्ये रूपांतर करून समाप्त होते, ज्यात प्रत्येक टप्पा आणि आर्टिफॅक्ट तज्ञांच्या पुनरावलोकनासाठी उपलब्ध असतो.

संगणकाच्या स्क्रीनवर एक वर्कस्पेस दिसत आहे, जे ctDNA उत्परिवर्तन डेटाचे अन्वेषण करण्यासाठी NGS विश्लेषण प्लगइन वापरण्याच्या सूचना देते. स्क्रीनवर "शीर्ष तपशीलवार हिस्टोलॉजी" आणि "उत्परिवर्तित cfDNA नमुन्यांनुसार शीर्ष बदललेले जनुके" असे लेबल असलेले अनेक बार चार्ट आहेत, जे कर्करोगाचे प्रकार आणि जनुकीय बदलांवरील डेटा प्रदर्शित करतात. मजकुरात डेटासेट, मुख्य निष्कर्ष आणि विश्लेषण पॅरामीटर्सचे वर्णन आहे.

Life Sciences NGS Analysis प्लगइन

scRNA-seq गुणवत्ता नियंत्रण आणि एनोटेशन

स्प्लिट-स्क्रीन बायोइन्फॉर्मेटिक्स वर्कफ्लोचा स्क्रीनशॉट. डाव्या पॅनलमध्ये एक एआय असिस्टंट पूर्ण झालेल्या सिंगल-सेल आरएनए सिक्वेन्सिंग (scRNA-seq) गुणवत्ता-नियंत्रण विश्लेषणाचा सारांश दाखवत आहे, ज्यामध्ये तयार केलेल्या फाइल्स, क्यूसी मेट्रिक्स, यूमॅप व्हिज्युअलायझेशन्स आणि सेल-टाइप ॲनोटेशन्स यांचा समावेश आहे. उजव्या पॅनलमध्ये “scRNA QC रिव्ह्यू” अहवाल प्रदर्शित केला आहे, ज्यामध्ये एकूण संख्या, शोधलेले जीन्स आणि मायटोकाँड्रियल टक्केवारीसाठी हिस्टोग्राम आहेत, सोबतच क्यूसी पास/फेल संख्या आणि फिल्टर केलेल्या सेल पॉप्युलेशन्स दर्शवणारे बार चार्ट आहेत. हा इंटरफेस निळ्या आणि हिरव्या रंगाच्या ग्रेडियंट पार्श्वभूमीवर प्रदर्शित केला आहे.

10x-शैलीतील मॅट्रिक्स बंडलला QC-फिल्टर केलेल्या सिंगल-सेल आर्टिफॅक्ट्स, ॲनोटेशन्स आणि UMAPs मध्ये रूपांतरित करा, जे तुम्ही Codex मध्ये तपासू आणि सुधारू शकता. लाइफ सायन्सेस NGS ॲनालिसिस प्लगइन विनंतीला scrna-seq-qc कडे पाठवते, डेटामधून QC थ्रेशोल्ड निवडते, फिल्टरिंग आणि ॲनोटेशनच्या संदर्भातील मूळ स्रोत जपते, आणि गहाळ डबलेट-डिटेक्शन डिपेंडन्सीसारखे अडथळे समोर आणते.

बल्क RNA-seq FASTQ QC

RNA-seq कार्यप्रवाहाचे दुभागलेल्या पडद्यावरील दृश्य: डाव्या बाजूला, एका AI सहाय्यकाद्वारे पूर्ण झालेल्या 'बल्क RNA-seq' गुणवत्ता-नियंत्रण निष्कर्षांचा सारांश सादर केला आहे; तर उजव्या बाजूला, क्रमनिर्धारण आकडेवारी आणि 'Salmon' मेट्रिक्सचा समावेश असलेला एक संवादी MultiQC अहवाल प्रदर्शित केला आहे.

Bulk RNA-seq नमुना पत्रक, FASTQ bundle आणि संदर्भ संचिका वापरून QC-पुनरावलोकित गणना संच तयार करा, ज्याची Codex मध्ये तपासणी आणि पुनर्वापर करता येईल. Life Sciences NGS Analysis plugin विनंती प्रक्रिया करते, इनपुट्सचे प्रमाणीकरण करते आणि MultiQC, Salmon आव्यूह, उगम माहिती व स्पष्ट समाविष्ट असलेला यांसह ऑडिट करण्यायोग्य करण्यायोग्य प्रदान करते.

विश्वसनीय संस्थांसाठी विस्तारित प्रवेश

आम्ही GPT‑Rosalind मालिकेचा प्रवेश जागतिक स्तरावर पात्र संस्थांसाठी वाढवत आहोत. GPT‑Rosalind स्पष्ट सार्वजनिक हितासह वैध वैज्ञानिक संशोधन करणाऱ्या, मजबूत प्रशासन व सुरक्षा देखरेख असलेल्या, आणि एंटरप्राइज-ग्रेड सुरक्षेसह नियंत्रित प्रवेश असलेल्या संस्थांसाठी आमच्या विश्वसनीय-अॅक्सेस डिप्लॉयमेंट संरचनेद्वारे संशोधन पूर्वावलोकनात उपलब्ध असेल.

या जागतिक विस्ताराचा भाग म्हणून, GPT‑Rosalind च्या मदतीने Novo Nordisk च्या वैद्यकीय संशोधनाचा विस्तार करून रुग्णांपर्यंत नाविन्यपूर्ण उपचार पर्याय अधिक जलद पोहोचवण्याच्या त्यांच्या ध्येयाला पाठिंबा देताना आम्हाला आनंद होत आहे. Novo Nordisk संशोधकांना जटिल डेटासंचांचे विश्लेषण करण्यास, उपयुक्त नमुने शोधण्यास आणि गृहितके अधिक वेगाने तपासण्यास मदत करण्यासाठी अत्याधुनिक AI क्षमतांचा वापर करत आहे. GPT‑Rosalind ची अधिक सक्षम जैविक समज संशोधन संघांना साहित्य, जीनोमिक्स, ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स, अनुक्रम, संरचना आणि प्रायोगिक निष्कर्ष यांमधील पुरावे एकत्र जोडण्यास मदत करेल, ज्यामुळे डेटामधून अधिक स्पष्ट संशोधन निर्णय घेणे सुलभ होईल.

“जीवनविज्ञान संशोधन जटिल, डेटा-समृद्ध आणि आंतरशाखीय आहे. संशोधकांसाठी अर्थपूर्ण मूल्य देण्यासाठी, प्रगत AI मॉडेल्स विश्वसनीय वैज्ञानिक डेटावर आधारलेली, प्रमाणीकरण केलेल्या टूल्सशी जोडलेली आणि संशोधक दररोज वापरत असलेल्या प्रत्यक्ष वर्कफ्लोमध्ये समाकलित असली पाहिजेत. OpenAI सोबतच्या आमच्या भागीदारीबद्दल आणि GPT‑Rosalind औषध शोधासाठी अधिक काटेकोर, व्यावहारिक दृष्टिकोनांना कसे समर्थन देऊ शकते हे तपासण्याच्या संधीबद्दल आम्हाला आनंद आहे.”

Mishal Patel, समूह उपाध्यक्ष, AI आणि डिजिटल नवोन्मेष, R&D - Novo Nordisk

Enterprise खाते नसलेल्या पात्र संस्थांसाठी आम्ही आता OpenAI व्यवस्थापित वर्कस्पेसही देत आहोत.

पुढे काय

अद्ययावत GPT‑Rosalind हे वैज्ञानिक शोध प्रक्रियेला गती देण्यास मदत करणाऱ्या AI प्रणाली विकसित करण्याच्या आमच्या व्यापक वचनबद्धतेतील पुढचे पाऊल आहे, तसेच प्रगत जैविक क्षमतांचा वापर योग्य सुरक्षा उपायांसह केला जाईल याचीही खात्री देते. आम्ही मॉडेलची जैविक रीझनिंग अधिक सक्षम करणे, साधनांवर आधारित आणि दीर्घकालीन संशोधन कार्यप्रवाहांसाठी समर्थन वाढवणे, तसेच विविध प्रदेशांतील पात्र संस्थांसोबत काम करून त्याचा प्रत्यक्ष परिणाम मूल्यांकित करणे सुरू ठेवू.

याचा अर्थ औषध शोध आणि ट्रान्सलेशनल मेडिसिनपासून ते सार्वजनिक हेल्थ, तयारी आणि जैवसंरक्षण (biodefense) यांसारख्या उच्च-प्रभावी सार्वजनिक हिताच्या कामांमध्ये जीवन विज्ञान AI चा वापर करणे देखील होय. Rosalind Biodefense आणि आमच्या विश्वसनीय प्रवेशाधारित तैनाती मॉडेल च्या माध्यमातून, मानवाचे हेल्थ सुधारण्यासाठी आणि समाजाची लवचिकता अधिक मजबूत करण्यासाठी कार्यरत असलेल्या संशोधक, संस्था आणि संरक्षण क्षेत्रातील तज्ज्ञांच्या हाती अत्याधुनिक जैविक क्षमता उपलब्ध करून देण्याचे आमचे उद्दिष्ट आहे.

वैज्ञानिक संशोधनाच्या संपूर्ण जीवनचक्रात अधिक सक्षम भागीदार बनण्यासाठी आम्ही GPT‑Rosalind तयार करत राहू, ज्यामुळे वैज्ञानिकांना योग्य प्रश्नांपासून स्पष्ट पुरावे, चांगले प्रयोग आणि शेवटी रुग्णांसाठी नवीन उपचारांपर्यंत अधिक वेगाने जाता येईल.