Life Sciences NGS Analysis
Valdomas NKS analizės nukreipimas ir vietinis vykdymas
- Galimybės
- Interactive, Read, Write
- Kategorija
- Švietimas
- Programuotojas
- OpenAI
- Interneto svetainė
- (atsidaro naujame lange)
Kaip tai veikia
Valdomo pradinių duomenų priėmimo, nukreipimo ir vykdymo įskiepis naujos kartos sekoskaitos darbo eigoms. Jis padeda Codex patikrinti vietinius sekoskaitos duomenis, užduoti tik trūkstamus konkrečiam tyrimui aktualius klausimus, kai įmanoma, pasirinkti viešus arba laisvai prieinamus vykdymo metu įdiegiamus paketus, prieš diegiant patikrinti turimus įrankius ir vykdyti palaikomas vietines darbo eigas su patikra, žurnalais, aprašais, kokybės kontrolės ataskaitomis ir artefaktų rodyklėmis. Įskiepis suteikia išsamesnių sprendimų priėmimo galimybių, skirtų BCL demultipleksavimui, FASTQ kokybės kontrolei vykdyti ir interpretuoti, gemalinės linijos, somatiniams bei UMI skydelių DNR variantams, bendrosios RNA-seq duomenų skaičiavimui ir diferencinei raiškai, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag bei integruotai scRNA-seq kokybės kontrolei po skaičiavimo.
Ką dar galite padaryti?
Įvertinkite sekoskaitos kokybę
Gyvybės mokslų NKS analizė. Patikrinkite šiuos sekoskaitos duomenis ir patikslinkite analizės tikslą. Pasirinkite palaikomą kokybės kontrolės darbo eigą, patikrinkite būtinas sąlygas ir interpretuokite parengtas ataskaitas bei išsaugotus artefaktus.
Suplanuokite RNR sekoskaitos analizę
Gyvybės mokslų NKS analizė. Peržiūrėkite šio bendrosios RNA-seq tyrimo duomenis ir planą. Rekomenduokite palaikomą analizės darbo eigą, nurodykite trūkstamus metaduomenis ir paaiškinkite, ką reikia patikrinti prieš vykdant.
Interpretuokite sekoskaitos rezultatus
Gyvybės mokslų NKS analizė. Peržiūrėkite šiuos užbaigtos sekoskaitos analizės rezultatus. Apibendrinkite kokybės problemas ir rezultatus, atskirkite išvadas nuo prielaidų ir nurodykite jas pagrindžiančius failus.
Kas įtraukta
Įgūdžiai
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- Dar 10
Ištekliai
Pridėkite Life Sciences NGS Analysis įskiepį keliais spustelėjimais
Prieinamumą lemia įskiepis, jūsų planas ir darbo erdvės nuostatos. Tam tikroms sąsajoms reikia administratoriaus sąrankos arba patvirtinimo. Jei prieiga blokuojama, kreipkitės į savo darbo erdvės administratorių.
Naršyti susijusius įskiepius
Data
Paverskite duomenis aiškiais sprendimais.
Life Sciences Literature
Raskite biomedicinos straipsnius, preprintus ir atvirosios prieigos visus tekstus
NGS Analysis Workbench
Analizuokite sekoskaitos duomenis
BioRender
Raskite ir kurkite iliustracijas
Documents
Kurkite ir redaguokite dokumentus
Zotero
Raskite mokslinių straipsnių ir įterpkite nuorodas į šaltinius iš „Zotero“
