Негізгі мазмұнға өту
OpenAI

GPT‑Rosalind үшін жаңа мүмкіндіктерді таныстыру

Өмір туралы ғылымдар индустриясына нақты ғылыми жұмыс процестеріне негізделген жоғары интеллект әкелу.

Біз кәсіпорын ауқымындағы өмір туралы ғылымдар зерттеулеріне арнайы жасалған GPT‑Rosalind сериямыздың жаңа модель жаңартуын ұсынамыз. Ол GPT‑5.5‑тің агенттік бағдарламалау және құрал қолдану мүмкіндіктерін дәрілік химия мен геномика сияқты дәрі-дәрмек ашудың негізгі салаларындағы күштірек модель интеллектімен біріктіреді, әрі өмір туралы ғылымдардағы кеңірек талдау, жобалау және эксперименттік жұмыс процестерінде өнімділікті арттырады.

Өмір туралы ғылымдардағы прогресс деректер мен дәлелдерді әртүрлі масштабтар мен модальділіктер бойынша синтездеуге тәуелді: молекулалар, гендер, жолдар және тірі жүйелер. Біздің бағалауларымызда жаңартылған GPT‑Rosalind биология сарапшыларының зерттеу тапсырмаларында, күрделі дәрілік химия сұрауларында, сандық биологияда және wet lab ақауларын жоюда кең ауқымды өнімділік өсімін көрсетеді.

GPT‑Rosalind қазір сенімді қолжетімділікпен орналастыру құрылымымыз арқылы дүние жүзіндегі жарамды ұйымдарға зерттеу превьюі ретінде қолжетімді.

Ғылыми құнды тапсырмалардағы өнімділікті жақсарту

GPT‑Rosalind‑тің нақты әлемдегі әсерін өлшеу және үздіксіз жақсарту үшін біз LifeSciBench-ті жасадық: өмір туралы ғылымдар зерттеулеріндегі іргелі аспектілерге бағытталған, сыртқы сарапшылар бағалайтын бенчмарк. Модель өнімділігінің бір ғана компонентін немесе биологиялық саланы оқшау бағалайтын қолданыстағы бенчмарктардан айырмашылығы, LifeSciBench ғылыми құнды жұмысты түпкілікті тұрғыдан қарастырады және өмір туралы ғылымдар зерттеулерінің өзегіндегі алты жұмыс процесі аймағынан тапсырмалар алады: дәлелдермен жұмыс, талдау, жобалау және оңтайландыру, ғылыми ой қорыту, валидация және операциялар, сондай-ақ аударма және коммуникация. Біз бұл бенчмарк прогресті өмір туралы ғылымдар зерттеулерінің қажеттіліктері мен шынайы жағдайларына сәйкестендіру үшін қолданамыз.

GPT‑Rosalind индустрия және академиялық сарапшылар анықтаған ғылыми құнды тапсырмалар бойынша өнімділікте алда.

Күштірек ғылыми ой қорыту

Дәрілік химия

GPT‑Rosalind молекулаларды пайдалы дәрілерге айналдыруға бағытталған сала — дәрілік химияда салалық жетекші өнімділікке жетеді. Біз MedChemBench-ті нақты дәрілік химия жұмыс процестерін көрсету үшін жасадық: мультимодальді химиялық құрылымды түсінуді; құрылым-белсенділік байланысын (SAR); дәрінің қуатын, уыттылығын және сіңірілуін, таралуын, метаболизмін, шығарылуын (ADME) болжауды; көппараметрлі жетекші қосылысты оңтайландыру шешімдерін; және ретросинтезді бағалайды. GPT‑Rosalind MedChemBench-те GPT‑5.5‑тен 27,5% және 25,1% нәтижемен асып түседі, әрі 7,2% аз токен қолданады.

GPT‑Rosalind дәрілік химияда жақсырақ мультимодальді синтез және механизмдік ой қорыту көрсетеді.

Геномика және сандық биология

Геномика мен сандық биологиядағы ұзақ мерзімді, түпкілікті талдауға арналған агенттік бағалауымыз GeneBench-те GPT‑Rosalind GPT‑5.5‑тен 31% аз токен қолдана отырып, 21,6% және 20,4% салыстырмалы түрде жоғары дәлдікке жетеді. GeneBench ұзақ көкжиекті сандық тапсырмалардағы агенттік өнімділікті бағалайды: нақты ғылыми деректерге сүйене отырып, агент жарамды талдау, QC, модельдеу және түзетулерді жоспарлап, шешімге қатысты жауаптарға жете ала ма? Қамтылған мәселелер функционалдық геномика, кеңістіктік транскриптомика, протеомика, эпигеномика және қолданбалы генетика сияқты әртүрлі салаларды қамтиды.

GPT‑Rosalind дәлдікті жақсарта отырып, GPT‑5.5‑тен 31% аз токен қолданады.

Нақты зертханалық жұмысқа көмектесу

Біз GPT‑Rosalind‑тің нақты әлемде зертханалық жұмыс жүргізетін ғалымдарға көмектесу қабілетін тексеретін жаңа бағалауды енгіземіз. LabWorkBench модельдің ғалымдар қолданатын нақты wet lab протоколдарындағы perturbation-дарды эксперимент нәтижелерімен байланыстыру қабілетін тексереді; мақсаттар ақауларды жоюдан оңтайландыруға дейін қамтылады. LabWorkBench қолданатын деректер меншікті, сондықтан контаминацияланбаған. GPT‑Rosalind 63,2% жинайды, ал GPT‑5.5 — 55,8%, әрі ол 5,3% аз токен қолданады.

Нақты wet lab протоколдарына көмектесуде GPT‑Rosalind токен тиімділігін арттыра отырып, GPT‑5.5‑пен салыстырғанда айтарлықтай жақсару көрсетеді.

Ой қорытудан орындалатын жұмыс процестеріне

Біз Life Sciences Research(жаңа терезеде ашылады) және Life Sciences NGS Analysis(жаңа терезеде ашылады) плагиндерін жасап, GPT‑Rosalind арттырылған интеллектін қайталанатын ғылыми жұмыс процестеріне арналған практикалық орындау қабатымен кеңейттік. Бұл плагиндер бірге дереккөзге сүйенген дәлелдерді іздеуді, биологиялық интерпретацияны және биоинформатикалық орындауды бір жұмыс кеңістігіне әкеледі, зерттеушілерге сыртқы дәлелдерді ішкі омика талдауларымен байланыстыруға көмектеседі және артефактілер мен олардың шығу тегін сақтайды. Енді барлық пайдаланушылар екі плагинге де Codex арқылы қол жеткізе алады. Білікті GPT‑Rosalind кәсіпорын пайдаланушылары бұл плагиндерді қуаттандыру үшін GPT‑Rosalind‑ті қосымша қолдана алады.

Codex-ті ғалымдарға арналған динамикалық жұмыс үстелі ретінде тиімдірек пайдалану үшін біз биологияға тән файл түрлеріне арналған интерактивті қарау құралдарын қостық. Тізбек, туралау және құрылым қарау құралдарының бастапқы жиынтығы GPT‑Rosalind жұмыс процесі бойынша ой қорытып жатқанда ғалымдарды дәлелге жақын ұстауға және белсенді қарау құралын контекстте пайдаланып кейінгі сұрақтарға тікелей жауап беруге арналған.

Жоғарыдағы демо GPT‑Rosalind үйлестірген осы мүмкіндіктерді іс жүзінде көрсетеді. Біз емдеуді бағыттай алатын мутациялар мен басқа молекулалық өзгерістерді анықтау үшін сұйық ісік биопсиясын зерттеп жатқан ғалымның жолын бақылаймыз. Life Sciences NGS Analysis плагині өңделген ctDNA жазбаларын шолуды интерактивті notebook-қа айналдырып, зерттеуді KRAS G12C-ге шоғырландыратын қайталанатын өзгерістерді, төмен жиілікті calls және үлгі траекторияларын көрсетеді. Содан кейін Life Sciences Research плагині дереккөзге сүйенген target, inhibitor және resistance контекстін қосады, ал жергілікті тізбек, туралау және құрылым қарау құралдары ғалымға mutant residue 12-ні, оның RAS family бойынша сақталуын және inhibitor-bound pocket-ті тікелей тексеруге мүмкіндік береді. Жұмыс процесі бұл дәлелдерді нақты кейінгі әрекет нұсқаларына аударумен аяқталады, әр қадам мен артефакт сарапшылық шолу үшін қолжетімді.

Компьютер экранында ctDNA мутация деректерін зерттеу үшін NGS Analysis плагинін қолдануға нұсқау беретін жұмыс кеңістігі көрсетілген. Экранда қатерлі ісік түрлері мен ген өзгерістері туралы деректерді көрсететін «Ең егжей-тегжейлі гистологиялар» және «Мутацияланған cfDNA үлгілері бойынша ең көп өзгерген гендер» деп белгіленген бірнеше бағанды диаграмма бар. Мәтін деректер жиынын, негізгі нәтижелерді және талдау параметрлерін сипаттайды.

Life Sciences NGS Analysis плагині

scRNA-seq QC & аннотация

Бөлінген экрандағы биоинформатика жұмыс процесінің скриншоты. Сол жақ панельде ЖИ көмекшісі аяқталған біржасушалы РНҚ секвенирлеуінің (scRNA-seq) сапаны бақылау талдауын қорытындылайды. Оған жасалған файлдар, QC көрсеткіштері, UMAP визуализациялары және жасуша түрі аннотациялары кіреді. Оң жақ панельде жалпы есептеулер, анықталған гендер және митохондриялық пайыз бойынша гистограммалары бар «scRNA QC Review» есебі, сондай-ақ QC бойынша «өтті/өтпеді» есептері мен сүзілген жасуша популяцияларын көрсететін бағанды диаграммалар көрсетіледі. Интерфейс көк-жасыл градиентті фонда көрсетілген.

10x-style матрица бумасын Codex-те тексеріп, қайта қарай алатын QC-сүзілген single-cell артефактілерге, аннотацияларға және UMAP-тарға айналдырыңыз. Life Sciences NGS Analysis плагині сұрауды scrna-seq-qc-ге бағыттайды, деректерден QC шектерін таңдайды, сүзу мен аннотация айналасындағы provenance-ті сақтайды және жетіспейтін doublet-detection тәуелділіктері сияқты blockers-ті көрсетеді.

Bulk RNA-seq FASTQ QC

RNA-seq жұмыс процесінің бөлінген экран көрінісі: сол жақта ЖИ көмекшісі аяқталған bulk RNA-seq сапаны бақылау нәтижелерін қорытындылайды, ал оң жақта секвенирлеу статистикасы мен Salmon көрсеткіштері бар интерактивті MultiQC есебі көрсетіледі.

Bulk RNA-seq үлгі парағын, FASTQ бумасын және референс файлдарын Codex-те тексеріп, қайта қолдануға болатын, сапасы тексерілген есептеулер бумасына айналдырыңыз. Life Sciences NGS Analysis плагині сұрауды бағыттап, кірістерді валидациялайды және MultiQC, Salmon матрицалары, шығу тегі туралы ақпарат пен нақты ескертулері бар аудиттелетін орындалу пакетін қайтарады.

Сенімді ұйымдар үшін кеңейтілген қолжетімділік

Біз GPT‑Rosalind сериясына қолжетімділікті дүние жүзіндегі жарамды ұйымдарға кеңейтеміз. GPT‑Rosalind айқын қоғамдық пайдасы бар заңды ғылыми зерттеу жүргізетін, басқаруы мен қауіпсіздік қадағалауы мықты және кәсіпорын деңгейіндегі қауіпсіздігі бар бақыланатын қолжетімділігі бар ұйымдар үшін сенімді қолжетімділікпен орналастыру құрылымымыз арқылы зерттеу превьюі ретінде қолжетімді болады.

Осы жаһандық кеңею аясында біз Novo Nordisk-тің инновациялық емдеу нұсқаларын пациенттерге тезірек жеткізу миссиясын GPT‑Rosalind арқылы медициналық зерттеулерін ауқымдауға көмектесу арқылы қолдауға қуаныштымыз. Novo Nordisk зерттеушілерге күрделі деректер жиындарын талдауға, пайдалы заңдылықтарды ашуға және гипотезаларды тезірек тексеруге көмектесу үшін озық ЖИ мүмкіндіктерін пайдаланып жатыр. GPT‑Rosalind‑тің күштірек биологиялық түсінігі командаларға әдебиет, геномика, транскриптомика, тізбек, құрылым және эксперимент нәтижелері бойынша дәлелдерді байланыстыруға көмектеседі, бұл деректерден айқынырақ зерттеу шешімдеріне өтуді жеңілдетеді.

«Өмір туралы ғылымдар зерттеуі күрделі, деректерге бай және пәнаралық. Зерттеушілерге мәнді құндылық жеткізу үшін озық ЖИ модельдері сенімді ғылыми деректерге негізделуі, валидацияланған құралдармен байланысуы және зерттеушілер күн сайын қолданатын нақты жұмыс процестеріне интеграциялануы тиіс. Біз OpenAI-мен серіктестігімізге және GPT‑Rosalind дәрі-дәрмек ашуда неғұрлым қатаң әрі практикалық тәсілдерді қалай қолдай алатынын зерттеу мүмкіндігіне қуаныштымыз».

Мишал Пател, ЖИ және цифрлық инновациялар жөніндегі топтық вице-президент, R&D — Novo Nordisk

Біз сондай-ақ Enterprise аккаунты жоқ білікті ұйымдарға OpenAI басқаратын жұмыс кеңістігін ұсынып жатырмыз.

Келесі қадам

Жаңартылған GPT‑Rosalind — озық биологиялық мүмкіндіктердің тиісті қорғаныс шараларымен орналастырылуын қамтамасыз ете отырып, ғылыми жаңалықтарды жеделдетуге көмектесетін ЖИ жүйелерін құру жөніндегі кеңірек міндеттемеміздегі келесі қадам. Біз модельдің биологиялық ой қорытуын жақсартуды, құралдарға бай және ұзақ көкжиекті зерттеу жұмыс процестеріне қолдауды кеңейтуді және нақты әлемдегі әсерді бағалау үшін аймақтардағы білікті ұйымдармен жұмыс істеуді жалғастырамыз.

Бұл сондай-ақ өмір туралы ғылымдар ЖИ-ді дәрі-дәрмек ашудан және трансляциялық медицинадан бастап қоғамдық денсаулық, дайындық және биоқорғанысқа дейінгі жоғары әсерлі қоғамдық-пайдалы жұмысқа қолдануды білдіреді. Rosalind Biodefense және сенімді қолжетімділікпен орналастыру моделіміз арқылы біз озық биологиялық мүмкіндіктерді адам денсаулығын жақсарту және қоғамдық төзімділікті күшейту үшін жұмыс істейтін зерттеушілердің, институттардың және қорғаушылардың қолына беруді мақсат етеміз.

Біз GPT‑Rosalind-ті ғылыми зерттеудің толық өмірлік циклі бойынша анағұрлым қуатты серіктеске айналдыру үшін дамытуды жалғастырамыз: ғалымдарға дұрыс сұрақтардан айқынырақ дәлелдерге, жақсырақ эксперименттерге және ақырында пациенттерге арналған жаңа емдерге жылдамырақ өтуге көмектесеміз.