Life Sciences NGS Analysis
Pandhuan nemtokake alur NGS lan eksekusi lokal kanggo analisis sequencing
- Kemampuan
- Interactive, Read, Write
- Kategori
- Pendidikan
- Pangembang
- OpenAI
- Situs web
- (mbukak ing jendhela anyar)
Carane kerjane
Plugin kanthi pandhuan kanggo ngumpulake informasi, nemtokake alur, lan nglakokake alur kerja next-generation sequencing. Plugin iki mbantu Codex mriksa input sequencing lokal, mung takon bab khusus assay sing durung ana, milih paket publik utawa gratis sing bisa diinstal nalika runtime yen bisa, mriksa kasedhiyan piranti sadurunge instalasi, lan nglakokake alur kerja lokal sing didhukung kanthi validasi, log, manifes, laporan QC, lan indeks artefak. Plugin iki kalebu kaprigelan njupuk keputusan sing luwih jero kanggo demultiplexing BCL, eksekusi lan interpretasi QC FASTQ, varian DNA germline, somatik, lan panel UMI, panggawéan count bulk RNA-seq lan ekspresi diferensial, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag, sarta QC scRNA-seq pasca-count sing wis kagabung.
Apa manèh sing bisa njenengan tindakake?
Tinjau kualitas sequencing
Analisis NGS Ilmu Hayati: Priksa input sequencing iki lan jlentrehake tujuan analisise. Pilih alur kerja QC sing didhukung, priksa prasyarate, banjur interpretasikake laporan sing wis rampung lan artefak sing disimpen.
Rancang analisis RNA sequencing
Analisis NGS Ilmu Hayati: Tinjau input lan rancangan studi bulk RNA-seq iki. Saranake alur kerja analisis sing didhukung, temtokake metadata sing kurang, lan terangake pamriksan sing dibutuhake sadurunge eksekusi.
Interpretasikake asil sequencing
Analisis NGS Ilmu Hayati: Tinjau output analisis sequencing sing wis rampung iki. Ringkes masalah kualitas lan asile, bedakake temuan saka asumsi, lan wenehana rujukan menyang file panyengkuyunge.
Apa waé sing kalebu
Katrampilan
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 liyane
Sumber daya
Tambah plugin Life Sciences NGS Analysis mung nganggo sawetara klik
Kasedhiyan gumantung marang plugin, paket, lan setelan papan kerja njenengan. Sawetara sambungan mbutuhake persiyapan utawa persetujuan admin. Hubungi admin papan kerja njenengan yen akses diblokir.
