Inni í Genebench-Pro
Nánari skoðun á viðmiðinu, spurningum þess og stuðningsefni.
Þessar 10 tilviksrannsóknir sýna dæmigerðar spurningar úr GeneBench-Pro. Hver tilviksrannsókn inniheldur upprunalega kvaðningu, gagnasöfn og stuðningsefni. Sjá yfirlit yfir viðmiðunarpróf og helstu niðurstöður í tilkynningarbloggfærslu.
Athugið: Forskoðanir skráa sýna útdrætti úr gagnasöfnunum í heild.
Metið hvort tilbúinn hemill sem beinist að TXR1 hafi jákvætt klínískt notagildi í æxlum þar sem virkjun marksins er knúin áfram af byggingarfráviki. TXR1, TXR1i, DLR1 og merkingar fyrir star-allelu eru tilbúnar viðmiðunarmerkingar.
Markhópurinn þarf að vera greind út frá langtímaniðurstöðum, tjáningu, æxlisgæðum og lyfjafræðilegum gögnum áður en hægt er að túlka ávinning og eituráhrif sem meðferðarákvörðun.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Ákvarðið hvort augljós lncRNA-háðni sé umritunarsértæk eða knúin áfram af áhrifum á nærliggjandi gen og nágrannagen.
Umritunarstýrð sönnunargögn verða að standast samanburði fyrir staðbundnar truflanir á DNA-geni, bælingu á nágrannagenum, leiðaraskipti, eiturverkanir á GC og plötuáhrif.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Áætlaðu bein sjúkdómsáhrif tveggja nálægra próteina með fjölbreytugreiningu í cis Mendelskri slembun (cis-MVMR) og taktu tillit til mæliaðferðar, stefnu samsæta, sigurvegarabjögunar, LD og staðbundinnar eftirstæðrar fjölvirkni.
Próteinin tvö hafa sameiginlegt fylgnitengt genasæti. Greiningin þarf að færast frá jaðartengslum yfir í skilyrt sjúkdómsáhrif, sem taka tillit til LD, á sameiginlegum próteinkvarða.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Áætlaðu upprunasértæka tíðni arfbera, eftirstæða áhættu eftir neikvæða skimun, tíðni arfbera hjá maka og áhættu á að getnaðarafurð verði með sjúkdóminn út frá gögnum úr arfberaskimunarprófi.
Metið á eftirstæðri áhættu byggir á arfberagreiningarköllum sem taka tillit til sýndargena, samþjöppun stofnhaplótýpa, kvörðun greiningarprófa eftir uppruna og stöðlun frá prófuðum mökum aftur yfir í heildarskrá maka.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Metið áhrif arfgerðar á tjáningu virkjaðra einstofna frumna eftir að umhverfis-RNA og tæknileg mengun eru fjarlægð úr RNA-raðgreiningargögnum úr einni frumu.
Umhverfis-RNA hefur áhrif á bæði tjáningu marksins og merkjaspjaldið sem notað er til að kalla fram virkjunarástand, þannig að leiðrétting verður að eiga sér stað áður en eQTL líkanið er notað.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Metið hvort innfelld byggingarundirhaplotýpa innan nafnlauss umsnúningslíks genamóts hafi kvarðaða klíníska fylgni og trúverðugan stuðning við tjáningu.
Innfellt afritunar-skammtamerki getur ruglast vegna víðtækari öfugrar stefnu, þannig að skammtakvörðun, tjáningarstuðningur og klínísk líkanagerð verða að vera aðskilin.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Magngreindu mun á styrk Hi-C-lykkju í afmörkuðu tilvika-viðmiða sambandi eftir að gripir vegna lítillar vörpunarhæfni og byggingarbreytileika hafa verið fjarlægðir úr bakgrunni væntra snertinga
Marklykkjan er skilgreind með 20 kb upplausn, en líkanið fyrir væntar snertingar brenglast nema snertingar með litlum kortleggjanleika og SV-rönd sem er aðeins í tilfellahópi séu fyrst maskaðar.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Kortleggðu sæti magnbundins eiginleika á litningi 1 í endurröðuðu þýði með átta stofnendum með því að endurgera erfðauppruna frá stofnendum áður en tengsl við svipgerð eru prófuð.
Sýnilegu erfðamarkagögnin eru tvísamsæt, en líffræðilega merkið er ættaruppruni stofnenda. Verjanleg greining þarf því að endurgera stofnandaástand, athuga stefnu merkisins og aðgreina QTL frá óþægindatopp sem er samstilltur í lotu.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Álykta um foreldrissértæk hlutföll erfðauppruna og tímasetningu nýlegrar erfðablöndunar út frá fösuðum bútum staðbundins erfðauppruna, eftir leiðréttingu á gagnkvæmum skekkjum og litningasértækri viðsnúningu merkja.
Bæði upprunahlutföll og púlsatímar breytast ef rangt er farið með gerviáhrif gagnkvæmra búta, litningastaðbundinn merkjaumsnúning eða nefnara korta.
Útgefin kvaðning sem líkanið sýnir
Skrár sendar til líkansins
Ályktaðu út frá fornum tímaröðum yfir tíðni samsæta hvaða genasæti af tveimur einlitna genasætum sé undir sterkara jákvæðu vali, með tilliti til samsætustefnu, stefnubundinnar villu, erfðareks og breytilegrar stofnstærðar.
Hávaðasamir fornir ferlar eru ekki beint samanburðarhæfir fyrr en bæði genasætin eru sett á sama kvarða fyrir afleidda samsætu og fyrirliggjandi raðgreiningarvillugildi á sýnastigi eru líkanuð beint.