Life Sciences NGS Analysis
Насочван избор на NGS процес и локално изпълнение на анализ на секвениране
- Възможности
- Interactive, Read, Write
- Категория
- Образование
- Разработчик
- OpenAI
- Уебсайт
- (отваря се в нов прозорец)
Как работи
Плъгин с насочвано въвеждане, маршрутизиране и изпълнение за работни процеси за секвениране от ново поколение. Той помага на Codex да проверява локалните входни данни от секвениране, да задава само липсващите въпроси, специфични за изследването, да избира публични или свободно достъпни пакети, които могат да се инсталират по време на изпълнение, да проверява за налични инструменти преди инсталиране и да изпълнява поддържани локални работни процеси с валидиране, регистрационни файлове, манифести, отчети за контрол на качеството и индекси на артефактите. Той включва усъвършенствани умения за вземане на решения при демултиплексиране на BCL, изпълнение и интерпретиране на контрол на качеството на FASTQ, анализ на герминативни, соматични и UMI-панелни ДНК варианти, генериране на брояния и диференциална експресия при масово RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN/CUT&Tag и вграден контрол на качеството след преброяването при scRNA-seq.
Какво друго можете да направите?
Преглед на качеството на секвенирането
NGS анализ в науките за живота: Провери тези входни данни от секвениране и уточни целта на анализа. Избери поддържан процес за контрол на качеството, провери изискванията и интерпретирай готовите отчети със запазените артефакти.
Планиране на анализ на RNA секвениране
NGS анализ в науките за живота: Прегледай входните данни и дизайна на това изследване с масово RNA-seq. Препоръчай поддържан процес за анализ, посочи липсващите метаданни и обясни необходимите проверки преди изпълнение.
Интерпретиране на резултатите от секвенирането
NGS анализ в науките за живота: Прегледай тези готови резултати от анализа на секвенирането. Обобщи проблемите с качеството и резултатите, разграничи констатациите от допусканията и посочи подкрепящите ги файлове.
Какво е включено
Умения
- Amplicon Microbiome
- NGS Router
- ATAC-seq Peaks QC
- BCL to FASTQ
- Bulk RNA-seq
- Bulk RNA-seq Counts
- Bulk RNA-seq DE
- ChIP/CUT&RUN Peaks QC
- 10 още
Ресурси
Добавете плъгина Life Sciences NGS Analysis само с няколко щраквания
Достъпността зависи от плъгина, плана Ви и настройките на работното пространство. Някои връзки изискват настройка или одобрение от администратор. Свържете се с администратора на работното си пространство, ако достъпът е блокиран.
Разгледайте свързаните плъгини
Data
Превръщайте данните в ясни решения.
Life Sciences Literature
Намерете биомедицински статии, препринти и пълни текстове с отворен достъп
NGS Analysis Workbench
Анализирайте данни от секвениране
BioRender
Намирайте и създавайте фигури
Documents
Създавайте и редактирайте документи
Zotero
Намирайте научни статии и добавяйте позовавания от Zotero
